Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGO1Q5FBB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGO1Q5FBB7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGO1Q5FBB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGO1Q5FBB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGO1Q5FBB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGO1Q5FBB7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms