Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL27AP46776 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL27AP46776 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL27AP46776 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL27AP46776 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms