Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL1P37235 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HPCAL1P37235 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HPCAL1P37235 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL1P37235 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL1P37235 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL1P37235 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms