Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHGDHO43175 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHGDHO43175 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHGDHO43175 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHGDHO43175 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHGDHO43175 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHGDHO43175 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHGDHO43175 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHGDHO43175 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms