RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302006.3

IRX1-201, Transcript of iroquois homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX1, Length 1,858 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1-201ENST00000302006 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.72■■■■■ 7.15
IRX1-201ENST00000302006 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.22■■■■■ 5.95
IRX1-201ENST00000302006 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.14■■■■■ 5.62
IRX1-201ENST00000302006 ABCC9O60706 1549 aa49.49■■■■■ 5.51
IRX1-201ENST00000302006 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.35■■■■■ 5.49
IRX1-201ENST00000302006 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.27■■■■■ 5.48
IRX1-201ENST00000302006 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.82■■■■■ 5.41
IRX1-201ENST00000302006 NACADO15069 1562 aa48.6■■■■■ 5.37
IRX1-201ENST00000302006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.56■■■■■ 5.36
IRX1-201ENST00000302006 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.23■■■■■ 5.31
IRX1-201ENST00000302006 SCRIBQ14160 1630 aa48■■■■■ 5.27
IRX1-201ENST00000302006 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.54■■■■■ 5.2
IRX1-201ENST00000302006 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.9■■■■■ 5.1
IRX1-201ENST00000302006 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.61■■■■■ 5.05
IRX1-201ENST00000302006 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
IRX1-201ENST00000302006 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.46■■■■■ 5.03
IRX1-201ENST00000302006 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
IRX1-201ENST00000302006 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.17■■■■■ 4.98
IRX1-201ENST00000302006 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
IRX1-201ENST00000302006 SMARCA4P51532 1647 aa46■■■■■ 4.95
IRX1-201ENST00000302006 WIZO95785 1651 aa45.86■■■■■ 4.93
IRX1-201ENST00000302006 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
IRX1-201ENST00000302006 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.43■■■■■ 4.86
IRX1-201ENST00000302006 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
IRX1-201ENST00000302006 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.22■■■■■ 4.83
IRX1-201ENST00000302006 SMARCA2P51531 1590 aa45.17■■■■■ 4.82
IRX1-201ENST00000302006 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
IRX1-201ENST00000302006 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.84■■■■■ 4.77
IRX1-201ENST00000302006 NCAPD3P42695 1498 aa44.84■■■■■ 4.77
IRX1-201ENST00000302006 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.8■■■■■ 4.76
IRX1-201ENST00000302006 HMGXB3Q12766 1538 aa44.79■■■■■ 4.76
IRX1-201ENST00000302006 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.52■■■■■ 4.72
IRX1-201ENST00000302006 ABCC8Q09428 1581 aa43.87■■■■■ 4.61
IRX1-201ENST00000302006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.85■■■■■ 4.61
IRX1-201ENST00000302006 CFTRP13569 1480 aa43.81■■■■■ 4.6
IRX1-201ENST00000302006 PRDM2Q13029 1718 aa43.78■■■■■ 4.6
IRX1-201ENST00000302006 TRIM41Q8WV44 630 aa43.77■■■■■ 4.6
IRX1-201ENST00000302006 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.65■■■■■ 4.58
IRX1-201ENST00000302006 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
IRX1-201ENST00000302006 SYNJ1O43426 1573 aa43.45■■■■■ 4.55
IRX1-201ENST00000302006 NESP48681 1621 aa43.45■■■■■ 4.55
IRX1-201ENST00000302006 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.39■■■■■ 4.54
IRX1-201ENST00000302006 TOP2BQ02880 1626 aa43.25■■■■■ 4.51
IRX1-201ENST00000302006 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.24■■■■■ 4.51
IRX1-201ENST00000302006 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.2■■■■■ 4.51
IRX1-201ENST00000302006 CUX1P39880 1505 aa43.17■■■■■ 4.5
IRX1-201ENST00000302006 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.02■■■■■ 4.48
IRX1-201ENST00000302006 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
IRX1-201ENST00000302006 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.96■■■■■ 4.47
IRX1-201ENST00000302006 SOGA1O94964 1423 aa42.95■■■■■ 4.47
IRX1-201ENST00000302006 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.94■■■■■ 4.46
IRX1-201ENST00000302006 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.86■■■■■ 4.45
IRX1-201ENST00000302006 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.85■■■■■ 4.45
IRX1-201ENST00000302006 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.82■■■■■ 4.45
IRX1-201ENST00000302006 TOPBP1Q92547 1522 aa42.75■■■■■ 4.43
IRX1-201ENST00000302006 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
IRX1-201ENST00000302006 EEA1Q15075 1411 aa42.71■■■■■ 4.43
IRX1-201ENST00000302006 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.7■■■■■ 4.43
IRX1-201ENST00000302006 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
IRX1-201ENST00000302006 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.52■■■■■ 4.4
IRX1-201ENST00000302006 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.47■■■■■ 4.39
IRX1-201ENST00000302006 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.44■■■■■ 4.38
IRX1-201ENST00000302006 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.4■■■■■ 4.38
IRX1-201ENST00000302006 KIF27Q86VH2 1401 aa42.38■■■■■ 4.38
IRX1-201ENST00000302006 ERCC6Q03468 1493 aa42.38■■■■■ 4.37
IRX1-201ENST00000302006 CUX2O14529 1486 aa42.35■■■■■ 4.37
IRX1-201ENST00000302006 WDR97A6NE52 1622 aa42.33■■■■■ 4.37
IRX1-201ENST00000302006 WDR62O43379 1518 aa42.32■■■■■ 4.36
IRX1-201ENST00000302006 KIF21BO75037 1637 aa42.3■■■■■ 4.36
IRX1-201ENST00000302006 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.3■■■■■ 4.36
IRX1-201ENST00000302006 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
IRX1-201ENST00000302006 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
IRX1-201ENST00000302006 GOLGA3Q08378 1498 aa42.16■■■■■ 4.34
IRX1-201ENST00000302006 PRXQ9BXM0 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
IRX1-201ENST00000302006 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.09■■■■■ 4.33
IRX1-201ENST00000302006 IGF1RP08069 1367 aa42.06■■■■■ 4.32
IRX1-201ENST00000302006 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.05■■■■■ 4.32
IRX1-201ENST00000302006 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.01■■■■■ 4.32
IRX1-201ENST00000302006 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.98■■■■■ 4.31
IRX1-201ENST00000302006 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
IRX1-201ENST00000302006 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
IRX1-201ENST00000302006 IFT140Q96RY7 1462 aa41.9■■■■■ 4.3
IRX1-201ENST00000302006 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.88■■■■■ 4.29
IRX1-201ENST00000302006 CUL7Q14999 1698 aa41.82■■■■■ 4.29
IRX1-201ENST00000302006 PBRM1Q86U86 1689 aa41.82■■■■■ 4.28
IRX1-201ENST00000302006 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.82■■■■■ 4.28
IRX1-201ENST00000302006 CEP162Q5TB80 1403 aa41.78■■■■■ 4.28
IRX1-201ENST00000302006 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
IRX1-201ENST00000302006 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.27
IRX1-201ENST00000302006 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
IRX1-201ENST00000302006 GRIN2BQ13224 1484 aa41.56■■■■■ 4.24
IRX1-201ENST00000302006 ADAMTS12P58397 1594 aa41.49■■■■■ 4.23
IRX1-201ENST00000302006 CLIP1P30622 1438 aa41.48■■■■■ 4.23
IRX1-201ENST00000302006 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.42■■■■■ 4.22
IRX1-201ENST00000302006 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.4■■■■■ 4.22
IRX1-201ENST00000302006 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
IRX1-201ENST00000302006 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.35■■■■■ 4.21
IRX1-201ENST00000302006 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
IRX1-201ENST00000302006 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.19■■■■■ 4.18
IRX1-201ENST00000302006 ARAP1Q96P48 1450 aa41.18■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms