RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537739.5

HDGF-210, Transcript of heparin binding growth factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGF, Length 2,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGF-210ENST00000537739 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.05■■■■■ 6.72
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HDGF-210ENST00000537739 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.39■■■■■ 5.18
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HDGF-210ENST00000537739 SCRIBQ14160 1630 aa45.65■■■■■ 4.9
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HDGF-210ENST00000537739 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.46■■■■■ 4.71
HDGF-210ENST00000537739 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.23■■■■■ 4.67
HDGF-210ENST00000537739 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.23■■■■■ 4.67
HDGF-210ENST00000537739 BICRAQ9NZM4 1560 aa44■■■■■ 4.63
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HDGF-210ENST00000537739 SMARCA2P51531 1590 aa42.99■■■■■ 4.47
HDGF-210ENST00000537739 TRIM41Q8WV44 630 aa42.97■■■■■ 4.47
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HDGF-210ENST00000537739 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.76■■■■■ 4.44
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HDGF-210ENST00000537739 NCAPD3P42695 1498 aa42.3■■■■■ 4.36
HDGF-210ENST00000537739 HMGXB3Q12766 1538 aa42.19■■■■■ 4.34
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HDGF-210ENST00000537739 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
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HDGF-210ENST00000537739 EEA1Q15075 1411 aa41.49■■■■■ 4.23
HDGF-210ENST00000537739 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.47■■■■■ 4.23
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HDGF-210ENST00000537739 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.33■■■■■ 4.21
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HDGF-210ENST00000537739 PRDM2Q13029 1718 aa41.23■■■■■ 4.19
HDGF-210ENST00000537739 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.13■■■■■ 4.17
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HDGF-210ENST00000537739 PRXQ9BXM0 1461 aa40.69■■■■■ 4.1
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HDGF-210ENST00000537739 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.66■■■■■ 4.1
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HDGF-210ENST00000537739 IGF1RP08069 1367 aa40.45■■■■■ 4.07
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HDGF-210ENST00000537739 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.39■■■■■ 4.06
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HDGF-210ENST00000537739 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.26■■■■■ 4.04
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HDGF-210ENST00000537739 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
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HDGF-210ENST00000537739 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
HDGF-210ENST00000537739 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
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HDGF-210ENST00000537739 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.58■■■■□ 3.933e-7■■■■■ 35.7
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HDGF-210ENST00000537739 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.53■■■■□ 3.92
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