RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.82■■■■■ 7.01
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.17■■■■■ 5.78
HOXB3-212ENST00000498678 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.42■■■■■ 5.5
HOXB3-212ENST00000498678 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.61■■■■■ 5.37
HOXB3-212ENST00000498678 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.6■■■■■ 5.37
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC9O60706 1549 aa48.4■■■■■ 5.34
HOXB3-212ENST00000498678 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.11■■■■■ 5.29
HOXB3-212ENST00000498678 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.99■■■■■ 5.27
HOXB3-212ENST00000498678 NACADO15069 1562 aa47.67■■■■■ 5.22
HOXB3-212ENST00000498678 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.23■■■■■ 5.15
HOXB3-212ENST00000498678 SCRIBQ14160 1630 aa47.14■■■■■ 5.14
HOXB3-212ENST00000498678 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
HOXB3-212ENST00000498678 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.29■■■■■ 5
HOXB3-212ENST00000498678 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.87■■■■■ 4.93
HOXB3-212ENST00000498678 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.75■■■■■ 4.91
HOXB3-212ENST00000498678 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
HOXB3-212ENST00000498678 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
HOXB3-212ENST00000498678 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.48■■■■■ 4.87
HOXB3-212ENST00000498678 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
HOXB3-212ENST00000498678 SMARCA4P51532 1647 aa45.18■■■■■ 4.82
HOXB3-212ENST00000498678 WIZO95785 1651 aa45.09■■■■■ 4.81
HOXB3-212ENST00000498678 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.62■■■■■ 4.73
HOXB3-212ENST00000498678 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
HOXB3-212ENST00000498678 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
HOXB3-212ENST00000498678 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.44■■■■■ 4.71
HOXB3-212ENST00000498678 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.42■■■■■ 4.7
HOXB3-212ENST00000498678 SMARCA2P51531 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.2■■■■■ 4.67
HOXB3-212ENST00000498678 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
HOXB3-212ENST00000498678 NCAPD3P42695 1498 aa44.04■■■■■ 4.64
HOXB3-212ENST00000498678 HMGXB3Q12766 1538 aa43.94■■■■■ 4.63
HOXB3-212ENST00000498678 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.78■■■■■ 4.6
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM41Q8WV44 630 aa43.55■■■■■ 4.56
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
HOXB3-212ENST00000498678 CFTRP13569 1480 aa43.09■■■■■ 4.49
HOXB3-212ENST00000498678 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.99■■■■■ 4.47
HOXB3-212ENST00000498678 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.93■■■■■ 4.46
HOXB3-212ENST00000498678 SYNJ1O43426 1573 aa42.81■■■■■ 4.44
HOXB3-212ENST00000498678 PRDM2Q13029 1718 aa42.78■■■■■ 4.44
HOXB3-212ENST00000498678 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
HOXB3-212ENST00000498678 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.77■■■■■ 4.44
HOXB3-212ENST00000498678 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.76■■■■■ 4.44
HOXB3-212ENST00000498678 TOP2BQ02880 1626 aa42.61■■■■■ 4.41
HOXB3-212ENST00000498678 NESP48681 1621 aa42.55■■■■■ 4.4
HOXB3-212ENST00000498678 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.55■■■■■ 4.4
HOXB3-212ENST00000498678 SOGA1O94964 1423 aa42.53■■■■■ 4.4
HOXB3-212ENST00000498678 CUX1P39880 1505 aa42.51■■■■■ 4.4
HOXB3-212ENST00000498678 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
HOXB3-212ENST00000498678 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.44■■■■■ 4.38
HOXB3-212ENST00000498678 EEA1Q15075 1411 aa42.39■■■■■ 4.38
HOXB3-212ENST00000498678 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.38■■■■■ 4.37
HOXB3-212ENST00000498678 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.22■■■■■ 4.35
HOXB3-212ENST00000498678 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.2■■■■■ 4.35
HOXB3-212ENST00000498678 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.18■■■■■ 4.34
HOXB3-212ENST00000498678 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.14■■■■■ 4.34
HOXB3-212ENST00000498678 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.05■■■■■ 4.32
HOXB3-212ENST00000498678 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.02■■■■■ 4.32
HOXB3-212ENST00000498678 TOPBP1Q92547 1522 aa42■■■■■ 4.31
HOXB3-212ENST00000498678 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.97■■■■■ 4.31
HOXB3-212ENST00000498678 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
HOXB3-212ENST00000498678 KIF27Q86VH2 1401 aa41.88■■■■■ 4.3
HOXB3-212ENST00000498678 KIF21BO75037 1637 aa41.84■■■■■ 4.29
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA3Q08378 1498 aa41.82■■■■■ 4.29
HOXB3-212ENST00000498678 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
HOXB3-212ENST00000498678 CUX2O14529 1486 aa41.77■■■■■ 4.28
HOXB3-212ENST00000498678 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.74■■■■■ 4.27
HOXB3-212ENST00000498678 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.7■■■■■ 4.27
HOXB3-212ENST00000498678 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
HOXB3-212ENST00000498678 PRXQ9BXM0 1461 aa41.65■■■■■ 4.26
HOXB3-212ENST00000498678 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.64■■■■■ 4.26
HOXB3-212ENST00000498678 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.64■■■■■ 4.26
HOXB3-212ENST00000498678 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.62■■■■■ 4.25
HOXB3-212ENST00000498678 IGF1RP08069 1367 aa41.56■■■■■ 4.24
HOXB3-212ENST00000498678 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.54■■■■■ 4.24
HOXB3-212ENST00000498678 CEP162Q5TB80 1403 aa41.52■■■■■ 4.24
HOXB3-212ENST00000498678 WDR97A6NE52 1622 aa41.46■■■■■ 4.23
HOXB3-212ENST00000498678 ERCC6Q03468 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
HOXB3-212ENST00000498678 WDR62O43379 1518 aa41.4■■■■■ 4.22
HOXB3-212ENST00000498678 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
HOXB3-212ENST00000498678 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.33■■■■■ 4.21
HOXB3-212ENST00000498678 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
HOXB3-212ENST00000498678 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.28■■■■■ 4.2
HOXB3-212ENST00000498678 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
HOXB3-212ENST00000498678 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.21■■■■■ 4.19
HOXB3-212ENST00000498678 CLIP1P30622 1438 aa41.18■■■■■ 4.18
HOXB3-212ENST00000498678 CUL7Q14999 1698 aa41.13■■■■■ 4.18
HOXB3-212ENST00000498678 IFT140Q96RY7 1462 aa41.13■■■■■ 4.17
HOXB3-212ENST00000498678 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.162e-7■■■■□ 21.2
HOXB3-212ENST00000498678 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
HOXB3-212ENST00000498678 PBRM1Q86U86 1689 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXB3-212ENST00000498678 GRIN2BQ13224 1484 aa40.86■■■■■ 4.13
HOXB3-212ENST00000498678 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.86■■■■■ 4.13
HOXB3-212ENST00000498678 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.83■■■■■ 4.13
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
HOXB3-212ENST00000498678 ARAP1Q96P48 1450 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXB3-212ENST00000498678 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-212ENST00000498678 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.76■■■■■ 4.11
HOXB3-212ENST00000498678 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
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