Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F3O00716 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F3O00716 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F3O00716 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F3O00716 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F3O00716 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F3O00716 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F3O00716 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F3O00716 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F3O00716 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F3O00716 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F3O00716 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F3O00716 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F3O00716 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F3O00716 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
E2F3O00716 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F3O00716 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F3O00716 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F3O00716 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F3O00716 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F3O00716 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F3O00716 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F3O00716 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F3O00716 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F3O00716 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F3O00716 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F3O00716 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F3O00716 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F3O00716 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F3O00716 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F3O00716 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F3O00716 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F3O00716 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F3O00716 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F3O00716 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F3O00716 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F3O00716 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F3O00716 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F3O00716 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F3O00716 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F3O00716 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F3O00716 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F3O00716 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F3O00716 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F3O00716 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
E2F3O00716 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F3O00716 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F3O00716 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F3O00716 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F3O00716 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F3O00716 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F3O00716 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F3O00716 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F3O00716 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F3O00716 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F3O00716 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F3O00716 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F3O00716 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F3O00716 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F3O00716 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F3O00716 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F3O00716 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F3O00716 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F3O00716 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F3O00716 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F3O00716 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F3O00716 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F3O00716 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F3O00716 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F3O00716 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F3O00716 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F3O00716 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F3O00716 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F3O00716 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F3O00716 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F3O00716 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F3O00716 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F3O00716 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F3O00716 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F3O00716 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F3O00716 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F3O00716 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F3O00716 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F3O00716 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F3O00716 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F3O00716 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F3O00716 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F3O00716 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F3O00716 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F3O00716 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F3O00716 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F3O00716 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F3O00716 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms