Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRHL1Q9NZI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRHL1Q9NZI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRHL1Q9NZI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRHL1Q9NZI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRHL1Q9NZI5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRHL1Q9NZI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRHL1Q9NZI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRHL1Q9NZI5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRHL1Q9NZI5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms