Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD4L1Q9NU39 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192 ms