Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
FOXD4L1Q9NU39 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
FOXD4L1Q9NU39 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FOXD4L1Q9NU39 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FOXD4L1Q9NU39 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
FOXD4L1Q9NU39 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FOXD4L1Q9NU39 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FOXD4L1Q9NU39 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
FOXD4L1Q9NU39 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD4L1Q9NU39 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXD4L1Q9NU39 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
FOXD4L1Q9NU39 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FOXD4L1Q9NU39 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD4L1Q9NU39 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXD4L1Q9NU39 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
FOXD4L1Q9NU39 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FOXD4L1Q9NU39 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FOXD4L1Q9NU39 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FOXD4L1Q9NU39 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FOXD4L1Q9NU39 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FOXD4L1Q9NU39 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FOXD4L1Q9NU39 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FOXD4L1Q9NU39 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FOXD4L1Q9NU39 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FOXD4L1Q9NU39 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FOXD4L1Q9NU39 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FOXD4L1Q9NU39 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FOXD4L1Q9NU39 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FOXD4L1Q9NU39 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FOXD4L1Q9NU39 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FOXD4L1Q9NU39 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FOXD4L1Q9NU39 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
FOXD4L1Q9NU39 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FOXD4L1Q9NU39 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FOXD4L1Q9NU39 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FOXD4L1Q9NU39 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FOXD4L1Q9NU39 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FOXD4L1Q9NU39 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FOXD4L1Q9NU39 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FOXD4L1Q9NU39 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXD4L1Q9NU39 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FOXD4L1Q9NU39 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FOXD4L1Q9NU39 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FOXD4L1Q9NU39 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXD4L1Q9NU39 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD4L1Q9NU39 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FOXD4L1Q9NU39 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FOXD4L1Q9NU39 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FOXD4L1Q9NU39 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FOXD4L1Q9NU39 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FOXD4L1Q9NU39 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FOXD4L1Q9NU39 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
FOXD4L1Q9NU39 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD4L1Q9NU39 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FOXD4L1Q9NU39 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FOXD4L1Q9NU39 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FOXD4L1Q9NU39 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD4L1Q9NU39 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXD4L1Q9NU39 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXD4L1Q9NU39 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FOXD4L1Q9NU39 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FOXD4L1Q9NU39 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD4L1Q9NU39 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOXD4L1Q9NU39 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FOXD4L1Q9NU39 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FOXD4L1Q9NU39 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FOXD4L1Q9NU39 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FOXD4L1Q9NU39 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXD4L1Q9NU39 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FOXD4L1Q9NU39 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FOXD4L1Q9NU39 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXD4L1Q9NU39 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXD4L1Q9NU39 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD4L1Q9NU39 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXD4L1Q9NU39 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FOXD4L1Q9NU39 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD4L1Q9NU39 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD4L1Q9NU39 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD4L1Q9NU39 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD4L1Q9NU39 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FOXD4L1Q9NU39 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXD4L1Q9NU39 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD4L1Q9NU39 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXD4L1Q9NU39 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXD4L1Q9NU39 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXD4L1Q9NU39 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD4L1Q9NU39 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXD4L1Q9NU39 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FOXD4L1Q9NU39 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD4L1Q9NU39 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXD4L1Q9NU39 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD4L1Q9NU39 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms