Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMSS1Q9BQ75 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMSS1Q9BQ75 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMSS1Q9BQ75 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMSS1Q9BQ75 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMSS1Q9BQ75 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMSS1Q9BQ75 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMSS1Q9BQ75 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms