Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLRE1CQ96SD1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLRE1CQ96SD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLRE1CQ96SD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLRE1CQ96SD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCLRE1CQ96SD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCLRE1CQ96SD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms