RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557389.1

NFKBIA-209, Transcript of NFKB inhibitor alpha, humanhuman

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Gene NFKBIA, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIA-209ENST00000557389 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.78■■■■■ 8.12
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NFKBIA-209ENST00000557389 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.08■■■■■ 6.41
NFKBIA-209ENST00000557389 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.6■■■■■ 6.33
NFKBIA-209ENST00000557389 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.35■■■■■ 6.29
NFKBIA-209ENST00000557389 NACADO15069 1562 aa54.07■■■■■ 6.25
NFKBIA-209ENST00000557389 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.04■■■■■ 6.24
NFKBIA-209ENST00000557389 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.87■■■■■ 6.21
NFKBIA-209ENST00000557389 SCRIBQ14160 1630 aa53.13■■■■■ 6.1
NFKBIA-209ENST00000557389 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.03■■■■■ 6.08
NFKBIA-209ENST00000557389 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.87■■■■■ 6.05
NFKBIA-209ENST00000557389 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.24■■■■■ 5.95
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NFKBIA-209ENST00000557389 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.17■■■■■ 5.78
NFKBIA-209ENST00000557389 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.89■■■■■ 5.74
NFKBIA-209ENST00000557389 SMARCA4P51532 1647 aa50.83■■■■■ 5.73
NFKBIA-209ENST00000557389 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.8■■■■■ 5.72
NFKBIA-209ENST00000557389 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.75■■■■■ 5.72
NFKBIA-209ENST00000557389 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.65■■■■■ 5.7
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NFKBIA-209ENST00000557389 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
NFKBIA-209ENST00000557389 WIZO95785 1651 aa50.41■■■■■ 5.66
NFKBIA-209ENST00000557389 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.26■■■■■ 5.64
NFKBIA-209ENST00000557389 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.19■■■■■ 5.62
NFKBIA-209ENST00000557389 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.14■■■■■ 5.62
NFKBIA-209ENST00000557389 SMARCA2P51531 1590 aa50.14■■■■■ 5.62
NFKBIA-209ENST00000557389 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.85■■■■■ 5.57
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NFKBIA-209ENST00000557389 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.83■■■■■ 5.57
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NFKBIA-209ENST00000557389 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.49■■■■■ 5.35
NFKBIA-209ENST00000557389 CFTRP13569 1480 aa48.49■■■■■ 5.35
NFKBIA-209ENST00000557389 NESP48681 1621 aa48.45■■■■■ 5.35
NFKBIA-209ENST00000557389 PRDM2Q13029 1718 aa48.42■■■■■ 5.34
NFKBIA-209ENST00000557389 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.39■■■■■ 5.34
NFKBIA-209ENST00000557389 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.02■■■■■ 5.28
NFKBIA-209ENST00000557389 ABCC8Q09428 1581 aa47.99■■■■■ 5.27
NFKBIA-209ENST00000557389 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.99■■■■■ 5.27
NFKBIA-209ENST00000557389 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.97■■■■■ 5.27
NFKBIA-209ENST00000557389 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.84■■■■■ 5.25
NFKBIA-209ENST00000557389 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.8■■■■■ 5.24
NFKBIA-209ENST00000557389 ERCC6Q03468 1493 aa47.71■■■■■ 5.23
NFKBIA-209ENST00000557389 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.7■■■■■ 5.23
NFKBIA-209ENST00000557389 SYNJ1O43426 1573 aa47.63■■■■■ 5.21
NFKBIA-209ENST00000557389 CUX1P39880 1505 aa47.58■■■■■ 5.21
NFKBIA-209ENST00000557389 TRIM41Q8WV44 630 aa47.53■■■■■ 5.2
NFKBIA-209ENST00000557389 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.5■■■■■ 5.19
NFKBIA-209ENST00000557389 TOP2BQ02880 1626 aa47.49■■■■■ 5.19
NFKBIA-209ENST00000557389 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
NFKBIA-209ENST00000557389 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.47■■■■■ 5.19
NFKBIA-209ENST00000557389 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.47■■■■■ 5.19
NFKBIA-209ENST00000557389 TOPBP1Q92547 1522 aa47.41■■■■■ 5.18
NFKBIA-209ENST00000557389 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
NFKBIA-209ENST00000557389 WDR62O43379 1518 aa47.27■■■■■ 5.16
NFKBIA-209ENST00000557389 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.21■■■■■ 5.15
NFKBIA-209ENST00000557389 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
NFKBIA-209ENST00000557389 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.93■■■■■ 5.1
NFKBIA-209ENST00000557389 CUX2O14529 1486 aa46.92■■■■■ 5.1
NFKBIA-209ENST00000557389 SOGA1O94964 1423 aa46.9■■■■■ 5.1
NFKBIA-209ENST00000557389 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
NFKBIA-209ENST00000557389 WDR97A6NE52 1622 aa46.8■■■■■ 5.08
NFKBIA-209ENST00000557389 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.72■■■■■ 5.07
NFKBIA-209ENST00000557389 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.71■■■■■ 5.07
NFKBIA-209ENST00000557389 IFT140Q96RY7 1462 aa46.71■■■■■ 5.07
NFKBIA-209ENST00000557389 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
NFKBIA-209ENST00000557389 KIF27Q86VH2 1401 aa46.58■■■■■ 5.05
NFKBIA-209ENST00000557389 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
NFKBIA-209ENST00000557389 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.51■■■■■ 5.04
NFKBIA-209ENST00000557389 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.04
NFKBIA-209ENST00000557389 EEA1Q15075 1411 aa46.5■■■■■ 5.03
NFKBIA-209ENST00000557389 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
NFKBIA-209ENST00000557389 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.4■■■■■ 5.024e-7■■■■□ 23.9
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NFKBIA-209ENST00000557389 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.19■■■■■ 4.98
NFKBIA-209ENST00000557389 GRIN2BQ13224 1484 aa46.17■■■■■ 4.98
NFKBIA-209ENST00000557389 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.11■■■■■ 4.97
NFKBIA-209ENST00000557389 CUL7Q14999 1698 aa46.1■■■■■ 4.97
NFKBIA-209ENST00000557389 KIF21BO75037 1637 aa46.05■■■■■ 4.96
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NFKBIA-209ENST00000557389 PRXQ9BXM0 1461 aa46.01■■■■■ 4.96
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NFKBIA-209ENST00000557389 ADAMTS12P58397 1594 aa45.98■■■■■ 4.95
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NFKBIA-209ENST00000557389 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.85■■■■■ 4.93
NFKBIA-209ENST00000557389 SYNJ2O15056 1496 aa45.72■■■■■ 4.91
NFKBIA-209ENST00000557389 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
NFKBIA-209ENST00000557389 CHD1O14646 1710 aa45.66■■■■■ 4.9
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NFKBIA-209ENST00000557389 GRIN2AQ12879 1464 aa45.62■■■■■ 4.89
NFKBIA-209ENST00000557389 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
NFKBIA-209ENST00000557389 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.53■■■■■ 4.88
NFKBIA-209ENST00000557389 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.49■■■■■ 4.87
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