Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNDP1Q96KN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNDP1Q96KN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNDP1Q96KN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNDP1Q96KN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNDP1Q96KN2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNDP1Q96KN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNDP1Q96KN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNDP1Q96KN2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms