Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN12Q6ZSI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CAPN12Q6ZSI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPN12Q6ZSI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN12Q6ZSI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN12Q6ZSI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN12Q6ZSI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN12Q6ZSI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms