Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAPN12Q6ZSI9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CAPN12Q6ZSI9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CAPN12Q6ZSI9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CAPN12Q6ZSI9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAPN12Q6ZSI9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CAPN12Q6ZSI9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAPN12Q6ZSI9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAPN12Q6ZSI9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CAPN12Q6ZSI9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CAPN12Q6ZSI9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CAPN12Q6ZSI9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CAPN12Q6ZSI9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CAPN12Q6ZSI9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAPN12Q6ZSI9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAPN12Q6ZSI9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CAPN12Q6ZSI9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CAPN12Q6ZSI9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAPN12Q6ZSI9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAPN12Q6ZSI9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CAPN12Q6ZSI9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CAPN12Q6ZSI9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CAPN12Q6ZSI9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CAPN12Q6ZSI9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CAPN12Q6ZSI9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CAPN12Q6ZSI9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CAPN12Q6ZSI9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CAPN12Q6ZSI9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAPN12Q6ZSI9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CAPN12Q6ZSI9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAPN12Q6ZSI9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAPN12Q6ZSI9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAPN12Q6ZSI9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAPN12Q6ZSI9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPN12Q6ZSI9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAPN12Q6ZSI9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPN12Q6ZSI9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CAPN12Q6ZSI9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAPN12Q6ZSI9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPN12Q6ZSI9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPN12Q6ZSI9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPN12Q6ZSI9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAPN12Q6ZSI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPN12Q6ZSI9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPN12Q6ZSI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPN12Q6ZSI9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAPN12Q6ZSI9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAPN12Q6ZSI9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAPN12Q6ZSI9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAPN12Q6ZSI9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAPN12Q6ZSI9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAPN12Q6ZSI9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPN12Q6ZSI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAPN12Q6ZSI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAPN12Q6ZSI9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAPN12Q6ZSI9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAPN12Q6ZSI9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPN12Q6ZSI9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPN12Q6ZSI9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPN12Q6ZSI9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPN12Q6ZSI9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN12Q6ZSI9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPN12Q6ZSI9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPN12Q6ZSI9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPN12Q6ZSI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPN12Q6ZSI9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN12Q6ZSI9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN12Q6ZSI9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN12Q6ZSI9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN12Q6ZSI9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPN12Q6ZSI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPN12Q6ZSI9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN12Q6ZSI9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN12Q6ZSI9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN12Q6ZSI9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN12Q6ZSI9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CAPN12Q6ZSI9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN12Q6ZSI9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN12Q6ZSI9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN12Q6ZSI9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN12Q6ZSI9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN12Q6ZSI9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN12Q6ZSI9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN12Q6ZSI9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN12Q6ZSI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN12Q6ZSI9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN12Q6ZSI9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN12Q6ZSI9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN12Q6ZSI9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN12Q6ZSI9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN12Q6ZSI9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN12Q6ZSI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN12Q6ZSI9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms