Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35F1Q5T1Q4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35F1Q5T1Q4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F1Q5T1Q4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F1Q5T1Q4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35F1Q5T1Q4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC35F1Q5T1Q4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35F1Q5T1Q4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35F1Q5T1Q4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms