Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC12

MSS51, Putative protein MSS51 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSS51Q4VC12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSS51Q4VC12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSS51Q4VC12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MSS51Q4VC12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSS51Q4VC12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MSS51Q4VC12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MSS51Q4VC12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSS51Q4VC12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSS51Q4VC12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSS51Q4VC12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSS51Q4VC12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSS51Q4VC12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms