Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM11AP58511 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM11AP58511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM11AP58511 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM11AP58511 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM11AP58511 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM11AP58511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms