Protein–RNA interactions for Protein: P56385

ATP5I, ATP synthase subunit e, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5IP56385 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5IP56385 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5IP56385 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5IP56385 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5IP56385 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5IP56385 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5IP56385 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5IP56385 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5IP56385 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP5IP56385 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5IP56385 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5IP56385 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5IP56385 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP5IP56385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5IP56385 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5IP56385 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5IP56385 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5IP56385 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5IP56385 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5IP56385 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5IP56385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5IP56385 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5IP56385 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5IP56385 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5IP56385 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5IP56385 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5IP56385 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5IP56385 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms