Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP214P35658 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP214P35658 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP214P35658 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP214P35658 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP214P35658 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP214P35658 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP214P35658 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP214P35658 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP214P35658 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP214P35658 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP214P35658 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP214P35658 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP214P35658 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP214P35658 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP214P35658 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP214P35658 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP214P35658 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP214P35658 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP214P35658 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP214P35658 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP214P35658 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP214P35658 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP214P35658 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP214P35658 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP214P35658 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP214P35658 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP214P35658 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP214P35658 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP214P35658 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP214P35658 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP214P35658 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP214P35658 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP214P35658 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP214P35658 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP214P35658 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP214P35658 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP214P35658 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP214P35658 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP214P35658 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP214P35658 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP214P35658 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP214P35658 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP214P35658 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP214P35658 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP214P35658 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP214P35658 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP214P35658 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP214P35658 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP214P35658 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP214P35658 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP214P35658 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP214P35658 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP214P35658 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP214P35658 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP214P35658 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP214P35658 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP214P35658 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP214P35658 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP214P35658 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP214P35658 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP214P35658 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP214P35658 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP214P35658 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP214P35658 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP214P35658 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP214P35658 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP214P35658 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP214P35658 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP214P35658 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP214P35658 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP214P35658 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP214P35658 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP214P35658 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP214P35658 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP214P35658 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP214P35658 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP214P35658 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP214P35658 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP214P35658 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP214P35658 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP214P35658 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP214P35658 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP214P35658 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP214P35658 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP214P35658 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP214P35658 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP214P35658 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP214P35658 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP214P35658 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP214P35658 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP214P35658 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP214P35658 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP214P35658 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms