Protein–RNA interactions for Protein: P06729

CD2, T-cell surface antigen CD2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2P06729 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD2P06729 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2P06729 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2P06729 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD2P06729 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD2P06729 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD2P06729 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD2P06729 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD2P06729 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD2P06729 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD2P06729 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD2P06729 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD2P06729 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD2P06729 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD2P06729 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2P06729 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2P06729 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2P06729 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2P06729 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD2P06729 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2P06729 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD2P06729 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD2P06729 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2P06729 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2P06729 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2P06729 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2P06729 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD2P06729 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD2P06729 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2P06729 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2P06729 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD2P06729 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD2P06729 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD2P06729 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD2P06729 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2P06729 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2P06729 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2P06729 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD2P06729 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2P06729 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2P06729 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2P06729 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2P06729 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2P06729 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD2P06729 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD2P06729 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD2P06729 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD2P06729 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD2P06729 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD2P06729 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD2P06729 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD2P06729 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2P06729 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2P06729 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2P06729 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2P06729 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2P06729 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2P06729 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2P06729 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2P06729 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD2P06729 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD2P06729 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD2P06729 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD2P06729 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD2P06729 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD2P06729 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD2P06729 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD2P06729 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD2P06729 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD2P06729 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD2P06729 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD2P06729 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2P06729 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD2P06729 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD2P06729 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD2P06729 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2P06729 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2P06729 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD2P06729 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2P06729 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD2P06729 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2P06729 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD2P06729 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD2P06729 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD2P06729 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD2P06729 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD2P06729 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms