Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF21O75509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF21O75509 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF21O75509 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF21O75509 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF21O75509 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF21O75509 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF21O75509 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF21O75509 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF21O75509 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF21O75509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF21O75509 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF21O75509 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF21O75509 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF21O75509 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms