Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SMTNL1A8MU46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMTNL1A8MU46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMTNL1A8MU46 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMTNL1A8MU46 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SMTNL1A8MU46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMTNL1A8MU46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMTNL1A8MU46 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMTNL1A8MU46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMTNL1A8MU46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMTNL1A8MU46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMTNL1A8MU46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMTNL1A8MU46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms