Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMTNL1A8MU46 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SMTNL1A8MU46 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SMTNL1A8MU46 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMTNL1A8MU46 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMTNL1A8MU46 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SMTNL1A8MU46 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMTNL1A8MU46 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMTNL1A8MU46 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMTNL1A8MU46 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMTNL1A8MU46 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMTNL1A8MU46 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SMTNL1A8MU46 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SMTNL1A8MU46 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SMTNL1A8MU46 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMTNL1A8MU46 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMTNL1A8MU46 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMTNL1A8MU46 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMTNL1A8MU46 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMTNL1A8MU46 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMTNL1A8MU46 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMTNL1A8MU46 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMTNL1A8MU46 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMTNL1A8MU46 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMTNL1A8MU46 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMTNL1A8MU46 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMTNL1A8MU46 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMTNL1A8MU46 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SMTNL1A8MU46 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SMTNL1A8MU46 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMTNL1A8MU46 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMTNL1A8MU46 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMTNL1A8MU46 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMTNL1A8MU46 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMTNL1A8MU46 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMTNL1A8MU46 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMTNL1A8MU46 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMTNL1A8MU46 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMTNL1A8MU46 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMTNL1A8MU46 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMTNL1A8MU46 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMTNL1A8MU46 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMTNL1A8MU46 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMTNL1A8MU46 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMTNL1A8MU46 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMTNL1A8MU46 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMTNL1A8MU46 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMTNL1A8MU46 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMTNL1A8MU46 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMTNL1A8MU46 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMTNL1A8MU46 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMTNL1A8MU46 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMTNL1A8MU46 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMTNL1A8MU46 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMTNL1A8MU46 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMTNL1A8MU46 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMTNL1A8MU46 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMTNL1A8MU46 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMTNL1A8MU46 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMTNL1A8MU46 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMTNL1A8MU46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMTNL1A8MU46 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMTNL1A8MU46 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMTNL1A8MU46 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMTNL1A8MU46 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMTNL1A8MU46 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMTNL1A8MU46 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMTNL1A8MU46 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMTNL1A8MU46 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMTNL1A8MU46 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMTNL1A8MU46 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMTNL1A8MU46 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMTNL1A8MU46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMTNL1A8MU46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMTNL1A8MU46 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMTNL1A8MU46 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SMTNL1A8MU46 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMTNL1A8MU46 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMTNL1A8MU46 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
SMTNL1A8MU46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMTNL1A8MU46 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMTNL1A8MU46 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SMTNL1A8MU46 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SMTNL1A8MU46 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMTNL1A8MU46 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SMTNL1A8MU46 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMTNL1A8MU46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMTNL1A8MU46 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMTNL1A8MU46 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMTNL1A8MU46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMTNL1A8MU46 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMTNL1A8MU46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMTNL1A8MU46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMTNL1A8MU46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMTNL1A8MU46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SMTNL1A8MU46 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMTNL1A8MU46 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMTNL1A8MU46 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMTNL1A8MU46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMTNL1A8MU46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms