Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC182A6NF36 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC182A6NF36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC182A6NF36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC182A6NF36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC182A6NF36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC182A6NF36 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC182A6NF36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC182A6NF36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms