Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 216.46■□□□□ 0.233e-56■■■■■ 143
TARDBPQ13148 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 215.78■□□□□ 0.123e-10■■■■■ 130
TARDBPQ13148 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 213.89□□□□□ -0.193e-10■■■■■ 130
TARDBPQ13148 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 513.03□□□□□ -0.323e-10■■■■■ 130
TARDBPQ13148 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 130
TARDBPQ13148 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 130
TARDBPQ13148 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.774e-26■■■■■ 118.9
TARDBPQ13148 PGK1-205ENST00000491291 702 ntTSL 58.51□□□□□ -1.054e-26■■■■■ 118.9
TARDBPQ13148 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 118.2
TARDBPQ13148 STARD7-204ENST00000479456 2949 ntTSL 26.68□□□□□ -1.342e-12■■■■■ 118.2
TARDBPQ13148 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 519.47■□□□□ 0.714e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 218.87■□□□□ 0.614e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 218.23■□□□□ 0.514e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 217.54■□□□□ 0.44e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 317.47■□□□□ 0.394e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 212.93□□□□□ -0.344e-32■■■■■ 95.5
TARDBPQ13148 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 510.18□□□□□ -0.781e-23■■■■■ 87.1
TARDBPQ13148 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-23■■■■■ 87.1
TARDBPQ13148 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-23■■■■■ 87.1
TARDBPQ13148 AC005062.1-208ENST00000428100 469 ntTSL 37.4□□□□□ -1.226e-25■■■■■ 86
TARDBPQ13148 AC005062.1-205ENST00000437191 571 ntTSL 25.38□□□□□ -1.556e-25■■■■■ 86
TARDBPQ13148 AC005062.1-203ENST00000435968 551 ntTSL 22.94□□□□□ -1.946e-25■■■■■ 86
TARDBPQ13148 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.5■□□□□ 0.391e-323■■■■■ 85
TARDBPQ13148 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.381e-323■■■■■ 85
TARDBPQ13148 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.758e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.38e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.348e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 210.24□□□□□ -0.778e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 317.99■□□□□ 0.474e-19■■■■■ 79.8
TARDBPQ13148 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.474e-19■■■■■ 79.8
TARDBPQ13148 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 73.8
TARDBPQ13148 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.479e-10■■■■■ 73.5
TARDBPQ13148 MED24-209ENST00000491466 957 ntTSL 513.2□□□□□ -0.31e-38■■■■■ 73.3
TARDBPQ13148 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.116e-20■■■■■ 73.3
TARDBPQ13148 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 212.03□□□□□ -0.486e-20■■■■■ 73.3
TARDBPQ13148 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.56e-20■■■■■ 73.3
TARDBPQ13148 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-20■■■■■ 73.3
TARDBPQ13148 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 326.48■■□□□ 1.838e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.458e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 517.51■□□□□ 0.398e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 314.61□□□□□ -0.078e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.498e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 311.59□□□□□ -0.558e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 49.38□□□□□ -0.918e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 48.34□□□□□ -1.078e-11■■■■■ 73.2
TARDBPQ13148 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.641e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 216.93■□□□□ 0.31e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 216.78■□□□□ 0.281e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.021e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-218ENST00000519838 396 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 213.61□□□□□ -0.231e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.571e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.811e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.14□□□□□ -1.431e-14■■■■■ 72.7
TARDBPQ13148 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.447e-9■■■■■ 71.4
TARDBPQ13148 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.457e-9■■■■■ 71.4
TARDBPQ13148 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.111e-19■■■■■ 71.3
TARDBPQ13148 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-19■■■■■ 71.3
TARDBPQ13148 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.721e-19■■■■■ 71.3
TARDBPQ13148 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 37.71□□□□□ -1.181e-19■■■■■ 71.3
TARDBPQ13148 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.892e-16■■■■■ 71.2
TARDBPQ13148 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-16■■■■■ 71.2
TARDBPQ13148 EPRS-206ENST00000609181 2968 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.82e-16■■■■■ 71.2
TARDBPQ13148 DCAF6-211ENST00000489398 1727 ntTSL 27.28□□□□□ -1.244e-18■■■■■ 70.9
TARDBPQ13148 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.996e-16■■■■■ 70.2
TARDBPQ13148 BCLAF1-210ENST00000529826 2423 ntTSL 57.62□□□□□ -1.197e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.217e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-216ENST00000532384 3237 ntTSL 57.03□□□□□ -1.287e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.597e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.77e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.727e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.747e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-219ENST00000534269 4239 ntTSL 1 (best)3.91□□□□□ -1.787e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.817e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-212ENST00000530429 3167 ntTSL 53.35□□□□□ -1.877e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-206ENST00000527613 5640 ntTSL 1 (best)3.05□□□□□ -1.927e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.937e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 BCLAF1-224ENST00000640069 7719 ntTSL 51.25□□□□□ -2.217e-21■■■■■ 70.1
TARDBPQ13148 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.981e-13■■■■■ 69.7
TARDBPQ13148 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)20.99■□□□□ 0.951e-13■■■■■ 69.7
TARDBPQ13148 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-13■■■■■ 69.7
TARDBPQ13148 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-13■■■■■ 69.7
TARDBPQ13148 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.937e-21■■■■■ 69.2
TARDBPQ13148 ASL-202ENST00000362000 928 ntTSL 220.48■□□□□ 0.877e-21■■■■■ 69.2
TARDBPQ13148 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.487e-21■■■■■ 69.2
TARDBPQ13148 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.367e-21■■■■■ 69.2
TARDBPQ13148 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.167e-21■■■■■ 69.2
TARDBPQ13148 KANSL1-225ENST00000639356 1717 ntTSL 517.08■□□□□ 0.322e-22■■■■■ 68.8
TARDBPQ13148 KANSL1-213ENST00000576248 452 ntTSL 33.99□□□□□ -1.772e-22■■■■■ 68.8
TARDBPQ13148 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.19□□□□□ -1.11e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.61e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.781e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.81□□□□□ -1.81e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-18■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 RBM6-217ENST00000483350 988 ntTSL 314.13□□□□□ -0.152e-19■■■■■ 68.6
TARDBPQ13148 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-19■■■■■ 68.6
TARDBPQ13148 TMEM39A-202ENST00000438581 4393 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.172e-19■■■■■ 68.6
TARDBPQ13148 TMEM39A-206ENST00000473684 3043 ntTSL 55.22□□□□□ -1.572e-19■■■■■ 68.6
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 50.9 ms