Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91not detected
TARDBPQ13148 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88not detected
TARDBPQ13148 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81not detected
TARDBPQ13148 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78not detected
TARDBPQ13148 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73not detected
TARDBPQ13148 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69not detected
TARDBPQ13148 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66not detected
TARDBPQ13148 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.655e-13■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64not detected
TARDBPQ13148 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.645e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63not detected
TARDBPQ13148 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62not detected
TARDBPQ13148 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6not detected
TARDBPQ13148 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6not detected
TARDBPQ13148 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56not detected
TARDBPQ13148 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55not detected
TARDBPQ13148 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55not detected
TARDBPQ13148 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54not detected
TARDBPQ13148 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53not detected
TARDBPQ13148 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.59e-8■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.59e-8■■■■■ 28.7
TARDBPQ13148 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5not detected
TARDBPQ13148 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49not detected
TARDBPQ13148 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47not detected
TARDBPQ13148 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47not detected
TARDBPQ13148 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47not detected
TARDBPQ13148 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46not detected
TARDBPQ13148 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46not detected
TARDBPQ13148 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45not detected
TARDBPQ13148 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44not detected
TARDBPQ13148 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42not detected
TARDBPQ13148 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42not detected
TARDBPQ13148 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42not detected
TARDBPQ13148 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42not detected
TARDBPQ13148 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.413e-8■■■■■ 46.8
TARDBPQ13148 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41not detected
TARDBPQ13148 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41not detected
TARDBPQ13148 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39not detected
TARDBPQ13148 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39not detected
TARDBPQ13148 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38not detected
TARDBPQ13148 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38not detected
TARDBPQ13148 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.372e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36not detected
TARDBPQ13148 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32not detected
TARDBPQ13148 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31not detected
TARDBPQ13148 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3not detected
TARDBPQ13148 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.299e-16■■■■■ 51.6
TARDBPQ13148 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29not detected
TARDBPQ13148 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28not detected
TARDBPQ13148 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28not detected
TARDBPQ13148 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27not detected
TARDBPQ13148 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27not detected
TARDBPQ13148 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27not detected
TARDBPQ13148 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27not detected
TARDBPQ13148 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27not detected
TARDBPQ13148 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27not detected
TARDBPQ13148 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.267e-13■■□□□ 11.4
TARDBPQ13148 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26not detected
TARDBPQ13148 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25not detected
TARDBPQ13148 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25not detected
TARDBPQ13148 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25not detected
TARDBPQ13148 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24not detected
TARDBPQ13148 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24not detected
TARDBPQ13148 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24not detected
TARDBPQ13148 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24not detected
TARDBPQ13148 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23not detected
TARDBPQ13148 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.235e-6■□□□□ 11.3
TARDBPQ13148 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23not detected
TARDBPQ13148 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22not detected
TARDBPQ13148 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22not detected
TARDBPQ13148 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21not detected
TARDBPQ13148 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21not detected
TARDBPQ13148 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21not detected
TARDBPQ13148 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21not detected
TARDBPQ13148 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21not detected
TARDBPQ13148 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2not detected
TARDBPQ13148 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2not detected
TARDBPQ13148 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2not detected
TARDBPQ13148 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19not detected
TARDBPQ13148 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.198e-7■■■■■ 37.6
TARDBPQ13148 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19not detected
TARDBPQ13148 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18not detected
TARDBPQ13148 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17not detected
TARDBPQ13148 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16not detected
TARDBPQ13148 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15not detected
TARDBPQ13148 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms