RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487156.1

MICALL2-211, Transcript of MICAL like 2, humanhuman

TSL 5

Gene MICALL2, Length 874 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICALL2-211ENST00000487156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.73■■■■■ 5.23
MICALL2-211ENST00000487156 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.71■■■■■ 4.43
MICALL2-211ENST00000487156 ABCC9O60706 1549 aa42.33■■■■■ 4.37
MICALL2-211ENST00000487156 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.5■■■■■ 4.07
MICALL2-211ENST00000487156 NACADO15069 1562 aa40.31■■■■■ 4.04
MICALL2-211ENST00000487156 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.12■■■■■ 4.01
MICALL2-211ENST00000487156 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
MICALL2-211ENST00000487156 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
MICALL2-211ENST00000487156 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.5■■■■□ 3.91
MICALL2-211ENST00000487156 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.49■■■■□ 3.91
MICALL2-211ENST00000487156 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.91
MICALL2-211ENST00000487156 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.36■■■■□ 3.89
MICALL2-211ENST00000487156 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.25■■■■□ 3.87
MICALL2-211ENST00000487156 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.88■■■■□ 3.81
MICALL2-211ENST00000487156 SCRIBQ14160 1630 aa38.88■■■■□ 3.81
MICALL2-211ENST00000487156 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
MICALL2-211ENST00000487156 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.27■■■■□ 3.72
MICALL2-211ENST00000487156 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.13■■■■□ 3.69
MICALL2-211ENST00000487156 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.55
MICALL2-211ENST00000487156 SMARCA4P51532 1647 aa37.16■■■■□ 3.54
MICALL2-211ENST00000487156 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.12■■■■□ 3.53
MICALL2-211ENST00000487156 SMARCA2P51531 1590 aa37.07■■■■□ 3.52
MICALL2-211ENST00000487156 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
MICALL2-211ENST00000487156 HMGXB3Q12766 1538 aa36.96■■■■□ 3.51
MICALL2-211ENST00000487156 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.83■■■■□ 3.49
MICALL2-211ENST00000487156 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
MICALL2-211ENST00000487156 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.75■■■■□ 3.47
MICALL2-211ENST00000487156 ERCC6Q03468 1493 aa36.57■■■■□ 3.45
MICALL2-211ENST00000487156 NESP48681 1621 aa36.44■■■■□ 3.42
MICALL2-211ENST00000487156 CUX2O14529 1486 aa36.42■■■■□ 3.42
MICALL2-211ENST00000487156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.32■■■■□ 3.4
MICALL2-211ENST00000487156 WIZO95785 1651 aa36.31■■■■□ 3.4
MICALL2-211ENST00000487156 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
MICALL2-211ENST00000487156 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.11■■■■□ 3.37
MICALL2-211ENST00000487156 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.09■■■■□ 3.37
MICALL2-211ENST00000487156 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
MICALL2-211ENST00000487156 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.98■■■■□ 3.35
MICALL2-211ENST00000487156 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.98■■■■□ 3.35
MICALL2-211ENST00000487156 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
MICALL2-211ENST00000487156 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.76■■■■□ 3.32
MICALL2-211ENST00000487156 CFTRP13569 1480 aa35.74■■■■□ 3.31
MICALL2-211ENST00000487156 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.69■■■■□ 3.3
MICALL2-211ENST00000487156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.67■■■■□ 3.3
MICALL2-211ENST00000487156 WDR62O43379 1518 aa35.65■■■■□ 3.3
MICALL2-211ENST00000487156 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.5■■■■□ 3.27
MICALL2-211ENST00000487156 PRDM2Q13029 1718 aa35.38■■■■□ 3.25
MICALL2-211ENST00000487156 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
MICALL2-211ENST00000487156 ABCC8Q09428 1581 aa35.04■■■■□ 3.2
MICALL2-211ENST00000487156 TOPBP1Q92547 1522 aa35.02■■■■□ 3.2
MICALL2-211ENST00000487156 IFT140Q96RY7 1462 aa34.97■■■■□ 3.19
MICALL2-211ENST00000487156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.93■■■■□ 3.18
MICALL2-211ENST00000487156 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
MICALL2-211ENST00000487156 OSCARQ8IYS5 282 aa34.8■■■■□ 3.16
MICALL2-211ENST00000487156 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
MICALL2-211ENST00000487156 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
MICALL2-211ENST00000487156 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
MICALL2-211ENST00000487156 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
MICALL2-211ENST00000487156 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.126e-9■■■□□ 17
MICALL2-211ENST00000487156 SOGA1O94964 1423 aa34.55■■■■□ 3.12
MICALL2-211ENST00000487156 CUX1P39880 1505 aa34.52■■■■□ 3.12
MICALL2-211ENST00000487156 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.52■■■■□ 3.12
MICALL2-211ENST00000487156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.52■■■■□ 3.12
MICALL2-211ENST00000487156 TRIM41Q8WV44 630 aa34.51■■■■□ 3.12
MICALL2-211ENST00000487156 WDR97A6NE52 1622 aa34.42■■■■□ 3.1
MICALL2-211ENST00000487156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
MICALL2-211ENST00000487156 CHD1O14646 1710 aa34.32■■■■□ 3.08
MICALL2-211ENST00000487156 FBLN2P98095 1184 aa34.28■■■■□ 3.08
MICALL2-211ENST00000487156 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.26■■■■□ 3.07
MICALL2-211ENST00000487156 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.26■■■■□ 3.07
MICALL2-211ENST00000487156 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.26■■■■□ 3.07
MICALL2-211ENST00000487156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.23■■■■□ 3.07
MICALL2-211ENST00000487156 GRIN2BQ13224 1484 aa34.22■■■■□ 3.07
MICALL2-211ENST00000487156 ARHGEF11O15085 1522 aa34.21■■■■□ 3.07
MICALL2-211ENST00000487156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
MICALL2-211ENST00000487156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.16■■■■□ 3.06
MICALL2-211ENST00000487156 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.14■■■■□ 3.06
MICALL2-211ENST00000487156 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
MICALL2-211ENST00000487156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.11■■■■□ 3.05
MICALL2-211ENST00000487156 TOP2BQ02880 1626 aa34.08■■■■□ 3.05
MICALL2-211ENST00000487156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.08■■■■□ 3.05
MICALL2-211ENST00000487156 SYNJ2O15056 1496 aa34.07■■■■□ 3.04
MICALL2-211ENST00000487156 PBRM1Q86U86 1689 aa34.06■■■■□ 3.04
MICALL2-211ENST00000487156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.06■■■■□ 3.04
MICALL2-211ENST00000487156 SYNJ1O43426 1573 aa34.02■■■■□ 3.04
MICALL2-211ENST00000487156 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.97■■■■□ 3.03
MICALL2-211ENST00000487156 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.92■■■■□ 3.02
MICALL2-211ENST00000487156 ARAP1Q96P48 1450 aa33.88■■■■□ 3.01
MICALL2-211ENST00000487156 ADAMTS12P58397 1594 aa33.78■■■■□ 3
MICALL2-211ENST00000487156 GRIN2AQ12879 1464 aa33.77■■■■□ 3
MICALL2-211ENST00000487156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.75■■■□□ 2.99
MICALL2-211ENST00000487156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.73■■■□□ 2.99
MICALL2-211ENST00000487156 NUP160Q12769 1436 aa33.64■■■□□ 2.98
MICALL2-211ENST00000487156 CEP170Q5SW79 1584 aa33.6■■■□□ 2.97
MICALL2-211ENST00000487156 KIF27Q86VH2 1401 aa33.46■■■□□ 2.95
MICALL2-211ENST00000487156 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
MICALL2-211ENST00000487156 SHROOM2Q13796 1616 aa33.44■■■□□ 2.94
MICALL2-211ENST00000487156 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.41■■■□□ 2.94
MICALL2-211ENST00000487156 IGF1RP08069 1367 aa33.37■■■□□ 2.93
MICALL2-211ENST00000487156 CUL7Q14999 1698 aa33.33■■■□□ 2.93
MICALL2-211ENST00000487156 JPH4Q96JJ6 628 aa33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.6 ms