Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.5■□□□□ 0.391e-323■■■■■ 85
TARDBPQ13148 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.381e-323■■■■■ 85
TARDBPQ13148 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 417.14■□□□□ 0.331e-323■■■■■ 38.1
TARDBPQ13148 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 313.72□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NEAT1_3.1-201ENST00000613347 159 ntBASIC11.1□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC9.08□□□□□ -0.961e-323■■■■■ 35
TARDBPQ13148 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-323■■■■■ 35
TARDBPQ13148 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.241e-323■■■■■ 31
TARDBPQ13148 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.281e-323■■■■■ 38.1
TARDBPQ13148 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.291e-323■■■■■ 38.1
TARDBPQ13148 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.311e-323■■■■■ 38.1
TARDBPQ13148 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.471e-323■■■■■ 38.1
TARDBPQ13148 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 35.09□□□□□ -1.591e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 35
TARDBPQ13148 MALAT1-216ENST00000620465 333 ntTSL 24.55□□□□□ -1.681e-323■■■■■ 31
TARDBPQ13148 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 215.21■□□□□ 0.033e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 212.47□□□□□ -0.413e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 214.45□□□□□ -0.15e-74■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 FHOD1-209ENST00000569085 735 ntTSL 213.37□□□□□ -0.275e-74■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.495e-74■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.758e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.38e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.348e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 210.24□□□□□ -0.778e-68■■■■■ 82.4
TARDBPQ13148 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-67■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-67■■■■■ 35.6
TARDBPQ13148 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.174e-60■■■■■ 59.4
TARDBPQ13148 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 SEL1L3-210ENST00000513416 2344 ntTSL 28.79□□□□□ -14e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.214e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 PABPC1-202ENST00000517403 560 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-57■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.789e-57■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.379e-57■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 216.46■□□□□ 0.233e-56■■■■■ 143
TARDBPQ13148 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.558e-56■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-54■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.114e-54■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.084e-54■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-211ENST00000565835 905 ntTSL 317.66■□□□□ 0.427e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.337e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 514.61□□□□□ -0.077e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.377e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-217ENST00000568620 3390 ntTSL 211.3□□□□□ -0.67e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 ATP6V0D1-202ENST00000426604 1257 ntTSL 211.21□□□□□ -0.617e-54■■■■■ 54
TARDBPQ13148 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.711e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.441e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 220.41■□□□□ 0.861e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.121e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.311e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)5.43□□□□□ -1.541e-45■■■■■ 53.8
TARDBPQ13148 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.832e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-208ENST00000567060 945 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 514.15□□□□□ -0.142e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-43■■■■■ 32.4
TARDBPQ13148 PILRB-203ENST00000431140 772 ntTSL 313.61□□□□□ -0.237e-42■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.19□□□□□ -1.11e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.61e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.781e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.81□□□□□ -1.81e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.015e-40■■□□□ 14
TARDBPQ13148 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.375e-39■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-39■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-39■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 212.86□□□□□ -0.355e-39■■■■■ 38.3
TARDBPQ13148 MED24-209ENST00000491466 957 ntTSL 513.2□□□□□ -0.31e-38■■■■■ 73.3
TARDBPQ13148 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-37■■■■■ 34.2
TARDBPQ13148 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-37■■■■■ 34.2
TARDBPQ13148 BTNL9-208ENST00000512570 885 ntTSL 515.32■□□□□ 0.041e-37■■■■■ 34.2
TARDBPQ13148 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 215.27■□□□□ 0.042e-37■■■■■ 63.1
TARDBPQ13148 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-36■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-36■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.513e-36■■■■■ 51.8
TARDBPQ13148 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.73e-36■■■■■ 51.8
TARDBPQ13148 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 211.14□□□□□ -0.639e-36■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.5□□□□□ -0.899e-36■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-35■■■■■ 54.1
TARDBPQ13148 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.284e-35■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 510.11□□□□□ -0.796e-35■■■■■ 28.4
TARDBPQ13148 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.487e-35■■■■■ 64.5
TARDBPQ13148 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.172e-33■■■■■ 49.4
TARDBPQ13148 ACTR1A-207ENST00000636707 1046 ntTSL 512.62□□□□□ -0.392e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 ACTR1A-205ENST00000487599 2726 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 ACTR1A-202ENST00000470322 3519 ntTSL 29.02□□□□□ -0.972e-32■■■■■ 34.6
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