Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 27.38□□□□□ -1.238e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 26.09□□□□□ -1.438e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 26.04□□□□□ -1.448e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 25.24□□□□□ -1.578e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 LDHB-209ENST00000542765 672 ntTSL 24.56□□□□□ -1.682e-21■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.365e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.015e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 314.17□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.275e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CTSL-205ENST00000482054 908 ntTSL 213.34□□□□□ -0.275e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 210.95□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 29.01□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 26.39□□□□□ -1.395e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 URI1-204ENST00000570704 559 ntTSL 43.66□□□□□ -1.825e-7■□□□□ 8.1
TARDBPQ13148 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 39.18□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.263e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-202ENST00000279069 811 ntTSL 327.56■■■□□ 22e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-205ENST00000400318 1073 ntTSL 1 (best)26.57■■□□□ 1.842e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-203ENST00000361670 1239 ntTSL 523.18■■□□□ 1.32e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-7■□□□□ 8
TARDBPQ13148 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.472e-7■□□□□ 8
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