Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 522.55■■□□□ 1.21e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.521e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.431e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 515.62■□□□□ 0.091e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.031e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 413.23□□□□□ -0.291e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 38.58□□□□□ -1.046e-19■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 24.97□□□□□ -1.616e-19■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 223.06■■□□□ 1.286e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.196e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.076e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-212ENST00000538973 1456 ntTSL 520.82■□□□□ 0.926e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 220.58■□□□□ 0.886e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-206ENST00000535830 963 ntTSL 217.62■□□□□ 0.416e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-209ENST00000537212 821 ntTSL 317.46■□□□□ 0.396e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-217ENST00000541999 537 ntTSL 317.46■□□□□ 0.396e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-207ENST00000536995 4577 ntTSL 216.59■□□□□ 0.256e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-215ENST00000541367 1575 ntTSL 514.92□□□□□ -0.026e-22■■■■■ 68
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TARDBPQ13148 ATG16L2-210ENST00000537837 784 ntTSL 513.47□□□□□ -0.256e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.286e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-216ENST00000541554 295 ntTSL 312.76□□□□□ -0.376e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.357e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.097e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 313.42□□□□□ -0.267e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.817e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.617e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 218.97■□□□□ 0.638e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.448e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 313.39□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 211.32□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 67.1
TARDBPQ13148 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 315.38■□□□□ 0.056e-15■■■■■ 66
TARDBPQ13148 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-58■■■■■ 65.3
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TARDBPQ13148 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.214e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.384e-18■■■■■ 65.2
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TARDBPQ13148 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-18■■■■■ 65.2
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TARDBPQ13148 PLEKHA2-202ENST00000518939 669 ntTSL 57.68□□□□□ -1.184e-18■■■■■ 65.2
TARDBPQ13148 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.487e-35■■■■■ 64.5
TARDBPQ13148 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.44e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.064e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.064e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.154e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-215ENST00000576957 1159 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.464e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 321.58■■□□□ 1.058e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 215.14■□□□□ 0.018e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.198e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-205ENST00000591668 644 ntTSL 212.29□□□□□ -0.448e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-206ENST00000592642 396 ntTSL 39.47□□□□□ -0.898e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.292e-17■■■■■ 63.1
TARDBPQ13148 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-17■■■■■ 63.1
TARDBPQ13148 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 215.27■□□□□ 0.042e-37■■■■■ 63.1
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TARDBPQ13148 KLC1-220ENST00000555856 535 ntTSL 310.53□□□□□ -0.721e-16■■■■■ 63
TARDBPQ13148 KLC1-213ENST00000553325 976 ntTSL 210.44□□□□□ -0.741e-16■■■■■ 63
TARDBPQ13148 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-16■■■■■ 62.4
TARDBPQ13148 BMP2K-206ENST00000507670 1170 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.397e-19■■■■■ 61.8
TARDBPQ13148 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-17■■■■■ 61.8
TARDBPQ13148 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.414e-17■■■■■ 61.8
TARDBPQ13148 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.89□□□□□ -0.514e-17■■■■■ 61.8
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TARDBPQ13148 NPRL3-205ENST00000457916 936 ntTSL 517.04■□□□□ 0.328e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.268e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.158e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-202ENST00000419636 616 ntTSL 515.75■□□□□ 0.118e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.038e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 515.22■□□□□ 0.038e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-204ENST00000456528 794 ntTSL 514.31□□□□□ -0.128e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.188e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 312.76□□□□□ -0.378e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-207ENST00000468260 922 ntTSL 510.91□□□□□ -0.668e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 61.4
TARDBPQ13148 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-23■■■■■ 61.2
TARDBPQ13148 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-23■■■■■ 61.2
TARDBPQ13148 KLC1-215ENST00000553680 519 ntTSL 28.22□□□□□ -1.095e-31■■■■■ 61
TARDBPQ13148 NUP214-209ENST00000489260 649 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 60.8
TARDBPQ13148 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 313.72□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 35.09□□□□□ -1.591e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 60.1
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