Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPM4P67936 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPM4P67936 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPM4P67936 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TPM4P67936 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TPM4P67936 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TPM4P67936 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TPM4P67936 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TPM4P67936 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TPM4P67936 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TPM4P67936 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPM4P67936 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPM4P67936 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPM4P67936 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TPM4P67936 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TPM4P67936 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPM4P67936 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TPM4P67936 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TPM4P67936 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TPM4P67936 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPM4P67936 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TPM4P67936 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPM4P67936 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPM4P67936 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPM4P67936 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPM4P67936 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPM4P67936 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TPM4P67936 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TPM4P67936 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPM4P67936 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPM4P67936 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPM4P67936 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TPM4P67936 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TPM4P67936 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TPM4P67936 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TPM4P67936 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TPM4P67936 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TPM4P67936 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TPM4P67936 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPM4P67936 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPM4P67936 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPM4P67936 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPM4P67936 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPM4P67936 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPM4P67936 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPM4P67936 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPM4P67936 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPM4P67936 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPM4P67936 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPM4P67936 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPM4P67936 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPM4P67936 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPM4P67936 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TPM4P67936 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TPM4P67936 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TPM4P67936 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TPM4P67936 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TPM4P67936 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TPM4P67936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TPM4P67936 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TPM4P67936 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TPM4P67936 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TPM4P67936 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TPM4P67936 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TPM4P67936 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TPM4P67936 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TPM4P67936 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TPM4P67936 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TPM4P67936 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TPM4P67936 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TPM4P67936 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPM4P67936 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPM4P67936 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPM4P67936 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TPM4P67936 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TPM4P67936 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPM4P67936 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPM4P67936 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPM4P67936 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TPM4P67936 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TPM4P67936 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TPM4P67936 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM4P67936 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM4P67936 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM4P67936 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TPM4P67936 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TPM4P67936 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM4P67936 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM4P67936 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TPM4P67936 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TPM4P67936 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TPM4P67936 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TPM4P67936 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TPM4P67936 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPM4P67936 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPM4P67936 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TPM4P67936 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPM4P67936 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPM4P67936 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TPM4P67936 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms