RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372359.9

ARTN-202, Transcript of artemin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARTN, Length 1,921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARTN-202ENST00000372359 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.61■■■■■ 8.09
ARTN-202ENST00000372359 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.35■■■■■ 6.77
ARTN-202ENST00000372359 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.05■■■■■ 6.4
ARTN-202ENST00000372359 ABCC9O60706 1549 aa54.58■■■■■ 6.33
ARTN-202ENST00000372359 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.31■■■■■ 6.28
ARTN-202ENST00000372359 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.26■■■■■ 6.28
ARTN-202ENST00000372359 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.76■■■■■ 6.2
ARTN-202ENST00000372359 NACADO15069 1562 aa53.53■■■■■ 6.16
ARTN-202ENST00000372359 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.26■■■■■ 6.12
ARTN-202ENST00000372359 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.15■■■■■ 6.1
ARTN-202ENST00000372359 SCRIBQ14160 1630 aa52.7■■■■■ 6.03
ARTN-202ENST00000372359 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.02■■■■■ 5.92
ARTN-202ENST00000372359 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.56■■■■■ 5.84
ARTN-202ENST00000372359 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.42■■■■■ 5.82
ARTN-202ENST00000372359 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
ARTN-202ENST00000372359 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.02■■■■■ 5.76
ARTN-202ENST00000372359 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.78■■■■■ 5.72
ARTN-202ENST00000372359 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.68■■■■■ 5.7
ARTN-202ENST00000372359 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.67■■■■■ 5.7
ARTN-202ENST00000372359 SMARCA4P51532 1647 aa50.5■■■■■ 5.67
ARTN-202ENST00000372359 WIZO95785 1651 aa50.23■■■■■ 5.63
ARTN-202ENST00000372359 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
ARTN-202ENST00000372359 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.92■■■■■ 5.58
ARTN-202ENST00000372359 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.79■■■■■ 5.56
ARTN-202ENST00000372359 SMARCA2P51531 1590 aa49.73■■■■■ 5.55
ARTN-202ENST00000372359 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.71■■■■■ 5.55
ARTN-202ENST00000372359 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
ARTN-202ENST00000372359 NCAPD3P42695 1498 aa49.43■■■■■ 5.5
ARTN-202ENST00000372359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.39■■■■■ 5.5
ARTN-202ENST00000372359 HMGXB3Q12766 1538 aa49.31■■■■■ 5.48
ARTN-202ENST00000372359 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.21■■■■■ 5.47
ARTN-202ENST00000372359 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.71■■■■■ 5.39
ARTN-202ENST00000372359 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.5■■■■■ 5.35
ARTN-202ENST00000372359 CFTRP13569 1480 aa48.23■■■■■ 5.31
ARTN-202ENST00000372359 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.14■■■■■ 5.3
ARTN-202ENST00000372359 TRIM41Q8WV44 630 aa48.06■■■■■ 5.28
ARTN-202ENST00000372359 ABCC8Q09428 1581 aa48.04■■■■■ 5.28
ARTN-202ENST00000372359 PRDM2Q13029 1718 aa47.88■■■■■ 5.26
ARTN-202ENST00000372359 NESP48681 1621 aa47.82■■■■■ 5.25
ARTN-202ENST00000372359 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.79■■■■■ 5.24
ARTN-202ENST00000372359 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.78■■■■■ 5.24
ARTN-202ENST00000372359 SYNJ1O43426 1573 aa47.6■■■■■ 5.21
ARTN-202ENST00000372359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.59■■■■■ 5.21
ARTN-202ENST00000372359 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.45■■■■■ 5.19
ARTN-202ENST00000372359 TOP2BQ02880 1626 aa47.44■■■■■ 5.18
ARTN-202ENST00000372359 CUX1P39880 1505 aa47.41■■■■■ 5.18
ARTN-202ENST00000372359 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.37■■■■■ 5.17
ARTN-202ENST00000372359 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.32■■■■■ 5.17
ARTN-202ENST00000372359 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.2■■■■■ 5.15
ARTN-202ENST00000372359 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
ARTN-202ENST00000372359 SOGA1O94964 1423 aa47.09■■■■■ 5.13
ARTN-202ENST00000372359 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.08■■■■■ 5.13
ARTN-202ENST00000372359 TOPBP1Q92547 1522 aa47.03■■■■■ 5.12
ARTN-202ENST00000372359 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
ARTN-202ENST00000372359 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.94■■■■■ 5.11
ARTN-202ENST00000372359 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.93■■■■■ 5.1
ARTN-202ENST00000372359 EEA1Q15075 1411 aa46.91■■■■■ 5.1
ARTN-202ENST00000372359 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.84■■■■■ 5.09
ARTN-202ENST00000372359 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.83■■■■■ 5.09
ARTN-202ENST00000372359 ERCC6Q03468 1493 aa46.83■■■■■ 5.09
ARTN-202ENST00000372359 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
ARTN-202ENST00000372359 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.71■■■■■ 5.07
ARTN-202ENST00000372359 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.63■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 KIF27Q86VH2 1401 aa46.62■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 WDR62O43379 1518 aa46.61■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 CUX2O14529 1486 aa46.58■■■■■ 5.05
ARTN-202ENST00000372359 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ARTN-202ENST00000372359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.53■■■■■ 5.04
ARTN-202ENST00000372359 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.5■■■■■ 5.03
ARTN-202ENST00000372359 WDR97A6NE52 1622 aa46.37■■■■■ 5.01
ARTN-202ENST00000372359 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
ARTN-202ENST00000372359 KIF21BO75037 1637 aa46.3■■■■■ 5
ARTN-202ENST00000372359 IGF1RP08069 1367 aa46.27■■■■■ 5
ARTN-202ENST00000372359 GOLGA3Q08378 1498 aa46.24■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 PRXQ9BXM0 1461 aa46.23■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 IFT140Q96RY7 1462 aa46.22■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
ARTN-202ENST00000372359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.16■■■■■ 4.98
ARTN-202ENST00000372359 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.14■■■■■ 4.98
ARTN-202ENST00000372359 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.11■■■■■ 4.97
ARTN-202ENST00000372359 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.08■■■■■ 4.97
ARTN-202ENST00000372359 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
ARTN-202ENST00000372359 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.04■■■■■ 4.96
ARTN-202ENST00000372359 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.01■■■■■ 4.96
ARTN-202ENST00000372359 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.99■■■■■ 4.95
ARTN-202ENST00000372359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
ARTN-202ENST00000372359 CUL7Q14999 1698 aa45.89■■■■■ 4.94
ARTN-202ENST00000372359 PBRM1Q86U86 1689 aa45.82■■■■■ 4.93
ARTN-202ENST00000372359 GRIN2BQ13224 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
ARTN-202ENST00000372359 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
ARTN-202ENST00000372359 CEP162Q5TB80 1403 aa45.76■■■■■ 4.92
ARTN-202ENST00000372359 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.61■■■■■ 4.89
ARTN-202ENST00000372359 ADAMTS12P58397 1594 aa45.59■■■■■ 4.89
ARTN-202ENST00000372359 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.54■■■■■ 4.88
ARTN-202ENST00000372359 CLIP1P30622 1438 aa45.5■■■■■ 4.87
ARTN-202ENST00000372359 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
ARTN-202ENST00000372359 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
ARTN-202ENST00000372359 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.3■■■■■ 4.84
ARTN-202ENST00000372359 SYNJ2O15056 1496 aa45.29■■■■■ 4.84
ARTN-202ENST00000372359 GRIN2AQ12879 1464 aa45.24■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms