RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544233.5

WSB2-211, Transcript of WD repeat and SOCS box containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene WSB2, Length 2,503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSB2-211ENST00000544233 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.38■■■■■ 7.1
WSB2-211ENST00000544233 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.7■■■■■ 5.71
WSB2-211ENST00000544233 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.41■■■■■ 5.66
WSB2-211ENST00000544233 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.12■■■■■ 5.61
WSB2-211ENST00000544233 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.54■■■■■ 5.52
WSB2-211ENST00000544233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
WSB2-211ENST00000544233 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.6■■■■■ 5.37
WSB2-211ENST00000544233 ABCC9O60706 1549 aa47.6■■■■■ 5.21
WSB2-211ENST00000544233 SCRIBQ14160 1630 aa47.59■■■■■ 5.21
WSB2-211ENST00000544233 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.4■■■■■ 5.18
WSB2-211ENST00000544233 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.37■■■■■ 5.17
WSB2-211ENST00000544233 NACADO15069 1562 aa46.98■■■■■ 5.11
WSB2-211ENST00000544233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
WSB2-211ENST00000544233 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.47■■■■■ 5.03
WSB2-211ENST00000544233 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.36■■■■■ 5.01
WSB2-211ENST00000544233 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.22■■■■■ 4.99
WSB2-211ENST00000544233 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.09■■■■■ 4.97
WSB2-211ENST00000544233 WIZO95785 1651 aa45.98■■■■■ 4.95
WSB2-211ENST00000544233 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.86■■■■■ 4.93
WSB2-211ENST00000544233 TRIM41Q8WV44 630 aa45.69■■■■■ 4.91
WSB2-211ENST00000544233 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
WSB2-211ENST00000544233 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
WSB2-211ENST00000544233 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.44■■■■■ 4.86
WSB2-211ENST00000544233 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.42■■■■■ 4.86
WSB2-211ENST00000544233 SMARCA4P51532 1647 aa45.38■■■■■ 4.85
WSB2-211ENST00000544233 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.23■■■■■ 4.83
WSB2-211ENST00000544233 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.18■■■■■ 4.82
WSB2-211ENST00000544233 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.81
WSB2-211ENST00000544233 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
WSB2-211ENST00000544233 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.98■■■■■ 4.79
WSB2-211ENST00000544233 SMARCA2P51531 1590 aa44.92■■■■■ 4.78
WSB2-211ENST00000544233 HRCP23327 699 aa44.92■■■■■ 4.78
WSB2-211ENST00000544233 ABCC8Q09428 1581 aa44.78■■■■■ 4.76
WSB2-211ENST00000544233 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
WSB2-211ENST00000544233 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.45■■■■■ 4.71
WSB2-211ENST00000544233 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.32■■■■■ 4.69
WSB2-211ENST00000544233 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
WSB2-211ENST00000544233 SOGA1O94964 1423 aa44.2■■■■■ 4.67
WSB2-211ENST00000544233 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
WSB2-211ENST00000544233 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.07■■■■■ 4.64
WSB2-211ENST00000544233 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.97■■■■■ 4.63
WSB2-211ENST00000544233 SYNJ1O43426 1573 aa43.86■■■■■ 4.61
WSB2-211ENST00000544233 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.79■■■■■ 4.6
WSB2-211ENST00000544233 CEP162Q5TB80 1403 aa43.68■■■■■ 4.58
WSB2-211ENST00000544233 EEA1Q15075 1411 aa43.65■■■■■ 4.58
WSB2-211ENST00000544233 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
WSB2-211ENST00000544233 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.56■■■■■ 4.56
WSB2-211ENST00000544233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
WSB2-211ENST00000544233 NCAPD3P42695 1498 aa43.49■■■■■ 4.55
WSB2-211ENST00000544233 HMGXB3Q12766 1538 aa43.45■■■■■ 4.55
WSB2-211ENST00000544233 GOLGA3Q08378 1498 aa43.44■■■■■ 4.55
WSB2-211ENST00000544233 TOP2BQ02880 1626 aa43.28■■■■■ 4.52
WSB2-211ENST00000544233 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.24■■■■■ 4.51
WSB2-211ENST00000544233 KIF21BO75037 1637 aa43.2■■■■■ 4.51
WSB2-211ENST00000544233 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
WSB2-211ENST00000544233 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.14■■■■■ 4.5
WSB2-211ENST00000544233 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.13■■■■■ 4.5
WSB2-211ENST00000544233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
WSB2-211ENST00000544233 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.48
WSB2-211ENST00000544233 CUX1P39880 1505 aa43.05■■■■■ 4.48
WSB2-211ENST00000544233 CFTRP13569 1480 aa43.03■■■■■ 4.48
WSB2-211ENST00000544233 CLIP1P30622 1438 aa42.97■■■■■ 4.47
WSB2-211ENST00000544233 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.83■■■■■ 4.45
WSB2-211ENST00000544233 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
WSB2-211ENST00000544233 PRXQ9BXM0 1461 aa42.69■■■■■ 4.42
WSB2-211ENST00000544233 PRDM2Q13029 1718 aa42.69■■■■■ 4.42
WSB2-211ENST00000544233 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.68■■■■■ 4.42
WSB2-211ENST00000544233 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.65■■■■■ 4.42
WSB2-211ENST00000544233 KIF27Q86VH2 1401 aa42.61■■■■■ 4.41
WSB2-211ENST00000544233 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
WSB2-211ENST00000544233 APLP2Q06481 763 aa42.42■■■■■ 4.38
WSB2-211ENST00000544233 CUX2O14529 1486 aa42.41■■■■■ 4.38
WSB2-211ENST00000544233 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
WSB2-211ENST00000544233 ARAP1Q96P48 1450 aa42.37■■■■■ 4.37
WSB2-211ENST00000544233 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.36■■■■■ 4.37
WSB2-211ENST00000544233 NESP48681 1621 aa42.29■■■■■ 4.36
WSB2-211ENST00000544233 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.29■■■■■ 4.36
WSB2-211ENST00000544233 IGF1RP08069 1367 aa42.25■■■■■ 4.35
WSB2-211ENST00000544233 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.34
WSB2-211ENST00000544233 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.11■■■■■ 4.33
WSB2-211ENST00000544233 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.09■■■■■ 4.33
WSB2-211ENST00000544233 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.06■■■■■ 4.32
WSB2-211ENST00000544233 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.06■■■■■ 4.32
WSB2-211ENST00000544233 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.96■■■■■ 4.31
WSB2-211ENST00000544233 TOPBP1Q92547 1522 aa41.96■■■■■ 4.31
WSB2-211ENST00000544233 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
WSB2-211ENST00000544233 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.77■■■■■ 4.28
WSB2-211ENST00000544233 P3H3Q8IVL6 736 aa41.75■■■■■ 4.27
WSB2-211ENST00000544233 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
WSB2-211ENST00000544233 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.73■■■■■ 4.27
WSB2-211ENST00000544233 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
WSB2-211ENST00000544233 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
WSB2-211ENST00000544233 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
WSB2-211ENST00000544233 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.53■■■■■ 4.24
WSB2-211ENST00000544233 ITGAEP38570 1179 aa41.53■■■■■ 4.24
WSB2-211ENST00000544233 TIAM1Q13009 1591 aa41.52■■■■■ 4.24
WSB2-211ENST00000544233 WDR97A6NE52 1622 aa41.5■■■■■ 4.23
WSB2-211ENST00000544233 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.49■■■■■ 4.23
WSB2-211ENST00000544233 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
WSB2-211ENST00000544233 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.48■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms