RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378344.6

TPRG1L-202, Transcript of tumor protein p63 regulated 1 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TPRG1L, Length 2,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRG1L-202ENST00000378344 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.99■■■■■ 6.71
TPRG1L-202ENST00000378344 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.45■■■■■ 5.35
TPRG1L-202ENST00000378344 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.43■■■■■ 5.34
TPRG1L-202ENST00000378344 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
TPRG1L-202ENST00000378344 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
TPRG1L-202ENST00000378344 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.92■■■■■ 5.1
TPRG1L-202ENST00000378344 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.8■■■■■ 5.08
TPRG1L-202ENST00000378344 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.58■■■■■ 5.05
TPRG1L-202ENST00000378344 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.42■■■■■ 5.02
TPRG1L-202ENST00000378344 HRCP23327 699 aa45.98■■■■■ 4.95
TPRG1L-202ENST00000378344 ABCC9O60706 1549 aa45.6■■■■■ 4.89
TPRG1L-202ENST00000378344 SCRIBQ14160 1630 aa45.23■■■■■ 4.83
TPRG1L-202ENST00000378344 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.22■■■■■ 4.83
TPRG1L-202ENST00000378344 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
TPRG1L-202ENST00000378344 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.06■■■■■ 4.8
TPRG1L-202ENST00000378344 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
TPRG1L-202ENST00000378344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.75■■■■■ 4.75
TPRG1L-202ENST00000378344 NACADO15069 1562 aa44.71■■■■■ 4.75
TPRG1L-202ENST00000378344 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
TPRG1L-202ENST00000378344 TRIM41Q8WV44 630 aa44.45■■■■■ 4.71
TPRG1L-202ENST00000378344 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.33■■■■■ 4.69
TPRG1L-202ENST00000378344 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
TPRG1L-202ENST00000378344 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.25■■■■■ 4.67
TPRG1L-202ENST00000378344 WIZO95785 1651 aa44■■■■■ 4.63
TPRG1L-202ENST00000378344 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
TPRG1L-202ENST00000378344 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
TPRG1L-202ENST00000378344 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
TPRG1L-202ENST00000378344 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
TPRG1L-202ENST00000378344 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
TPRG1L-202ENST00000378344 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.4■■■■■ 4.54
TPRG1L-202ENST00000378344 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
TPRG1L-202ENST00000378344 SMARCA4P51532 1647 aa43.35■■■■■ 4.53
TPRG1L-202ENST00000378344 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.18■■■■■ 4.5
TPRG1L-202ENST00000378344 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.18■■■■■ 4.5
TPRG1L-202ENST00000378344 SMARCA2P51531 1590 aa43.16■■■■■ 4.5
TPRG1L-202ENST00000378344 ABCC8Q09428 1581 aa43.05■■■■■ 4.48
TPRG1L-202ENST00000378344 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.45
TPRG1L-202ENST00000378344 EEA1Q15075 1411 aa42.74■■■■■ 4.43
TPRG1L-202ENST00000378344 SOGA1O94964 1423 aa42.71■■■■■ 4.43
TPRG1L-202ENST00000378344 CEP162Q5TB80 1403 aa42.68■■■■■ 4.42
TPRG1L-202ENST00000378344 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.67■■■■■ 4.42
TPRG1L-202ENST00000378344 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.67■■■■■ 4.42
TPRG1L-202ENST00000378344 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.61■■■■■ 4.41
TPRG1L-202ENST00000378344 MYT1Q01538 1121 aa42.54■■■■■ 4.4
TPRG1L-202ENST00000378344 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.53■■■■■ 4.4
TPRG1L-202ENST00000378344 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
TPRG1L-202ENST00000378344 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.46■■■■■ 4.39
TPRG1L-202ENST00000378344 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
TPRG1L-202ENST00000378344 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
TPRG1L-202ENST00000378344 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
TPRG1L-202ENST00000378344 GOLGA3Q08378 1498 aa42.37■■■■■ 4.37
TPRG1L-202ENST00000378344 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
TPRG1L-202ENST00000378344 NEUROD1Q13562 356 aa42.21■■■■■ 4.35
TPRG1L-202ENST00000378344 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.17■■■■■ 4.34
TPRG1L-202ENST00000378344 SYNJ1O43426 1573 aa42.17■■■■■ 4.34
TPRG1L-202ENST00000378344 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.12■■■■■ 4.33
TPRG1L-202ENST00000378344 KIF21BO75037 1637 aa42.12■■■■■ 4.33
TPRG1L-202ENST00000378344 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
TPRG1L-202ENST00000378344 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
TPRG1L-202ENST00000378344 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa41.95■■■■■ 4.31
TPRG1L-202ENST00000378344 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
TPRG1L-202ENST00000378344 CLIP1P30622 1438 aa41.84■■■■■ 4.29
TPRG1L-202ENST00000378344 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TPRG1L-202ENST00000378344 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.74■■■■■ 4.27
TPRG1L-202ENST00000378344 TOP2BQ02880 1626 aa41.71■■■■■ 4.27
TPRG1L-202ENST00000378344 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.69■■■■■ 4.26
TPRG1L-202ENST00000378344 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.57■■■■■ 4.25
TPRG1L-202ENST00000378344 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
TPRG1L-202ENST00000378344 APLP2Q06481 763 aa41.43■■■■■ 4.22
TPRG1L-202ENST00000378344 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
TPRG1L-202ENST00000378344 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.42■■■■■ 4.22
TPRG1L-202ENST00000378344 HMGXB3Q12766 1538 aa41.4■■■■■ 4.22
TPRG1L-202ENST00000378344 PRXQ9BXM0 1461 aa41.37■■■■■ 4.21
TPRG1L-202ENST00000378344 NCAPD3P42695 1498 aa41.36■■■■■ 4.21
TPRG1L-202ENST00000378344 CUX1P39880 1505 aa41.2■■■■■ 4.19
TPRG1L-202ENST00000378344 ARAP1Q96P48 1450 aa41.17■■■■■ 4.18
TPRG1L-202ENST00000378344 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
TPRG1L-202ENST00000378344 KIF27Q86VH2 1401 aa41.08■■■■■ 4.17
TPRG1L-202ENST00000378344 CFTRP13569 1480 aa41.08■■■■■ 4.17
TPRG1L-202ENST00000378344 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.97■■■■■ 4.15
TPRG1L-202ENST00000378344 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
TPRG1L-202ENST00000378344 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
TPRG1L-202ENST00000378344 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
TPRG1L-202ENST00000378344 MIER1Q8N108 512 aa40.83■■■■■ 4.13
TPRG1L-202ENST00000378344 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
TPRG1L-202ENST00000378344 PRDM2Q13029 1718 aa40.79■■■■■ 4.12
TPRG1L-202ENST00000378344 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.78■■■■■ 4.12
TPRG1L-202ENST00000378344 CUX2O14529 1486 aa40.68■■■■■ 4.1
TPRG1L-202ENST00000378344 IGF1RP08069 1367 aa40.6■■■■■ 4.09
TPRG1L-202ENST00000378344 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.58■■■■■ 4.09
TPRG1L-202ENST00000378344 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.53■■■■■ 4.08
TPRG1L-202ENST00000378344 MAP3K1Q13233 1512 aa40.5■■■■■ 4.07
TPRG1L-202ENST00000378344 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.41■■■■■ 4.06
TPRG1L-202ENST00000378344 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.41■■■■■ 4.06
TPRG1L-202ENST00000378344 TIAM1Q13009 1591 aa40.4■■■■■ 4.06
TPRG1L-202ENST00000378344 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.24■■■■■ 4.03
TPRG1L-202ENST00000378344 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.2■■■■■ 4.03
TPRG1L-202ENST00000378344 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.19■■■■■ 4.02
TPRG1L-202ENST00000378344 ITGAEP38570 1179 aa40.17■■■■■ 4.02
TPRG1L-202ENST00000378344 MAPKBP1O60336 1514 aa40.12■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms