RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409288.5

IL1R1-201, Transcript of interleukin 1 receptor type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IL1R1, Length 1,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1R1-201ENST00000409288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.93■■■■■ 7.82
IL1R1-201ENST00000409288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.73■■■■■ 6.51
IL1R1-201ENST00000409288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.75■■■■■ 6.2
IL1R1-201ENST00000409288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.89■■■■■ 6.06
IL1R1-201ENST00000409288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.56■■■■■ 6
IL1R1-201ENST00000409288 ABCC9O60706 1549 aa52.45■■■■■ 5.99
IL1R1-201ENST00000409288 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.2■■■■■ 5.95
IL1R1-201ENST00000409288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.16■■■■■ 5.94
IL1R1-201ENST00000409288 NACADO15069 1562 aa51.81■■■■■ 5.88
IL1R1-201ENST00000409288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.31■■■■■ 5.81
IL1R1-201ENST00000409288 SCRIBQ14160 1630 aa51.21■■■■■ 5.79
IL1R1-201ENST00000409288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.42■■■■■ 5.66
IL1R1-201ENST00000409288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.22■■■■■ 5.63
IL1R1-201ENST00000409288 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.84■■■■■ 5.57
IL1R1-201ENST00000409288 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.66■■■■■ 5.54
IL1R1-201ENST00000409288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.63■■■■■ 5.54
IL1R1-201ENST00000409288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.45■■■■■ 5.51
IL1R1-201ENST00000409288 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.4■■■■■ 5.5
IL1R1-201ENST00000409288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.34■■■■■ 5.49
IL1R1-201ENST00000409288 SMARCA4P51532 1647 aa49.14■■■■■ 5.46
IL1R1-201ENST00000409288 WIZO95785 1651 aa49.03■■■■■ 5.44
IL1R1-201ENST00000409288 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.55■■■■■ 5.36
IL1R1-201ENST00000409288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.36
IL1R1-201ENST00000409288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
IL1R1-201ENST00000409288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.24■■■■■ 5.31
IL1R1-201ENST00000409288 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.23■■■■■ 5.31
IL1R1-201ENST00000409288 SMARCA2P51531 1590 aa48.23■■■■■ 5.31
IL1R1-201ENST00000409288 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.99■■■■■ 5.27
IL1R1-201ENST00000409288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
IL1R1-201ENST00000409288 NCAPD3P42695 1498 aa47.81■■■■■ 5.24
IL1R1-201ENST00000409288 HMGXB3Q12766 1538 aa47.79■■■■■ 5.24
IL1R1-201ENST00000409288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.53■■■■■ 5.2
IL1R1-201ENST00000409288 TRIM41Q8WV44 630 aa47.22■■■■■ 5.15
IL1R1-201ENST00000409288 ABCC8Q09428 1581 aa47.05■■■■■ 5.12
IL1R1-201ENST00000409288 CFTRP13569 1480 aa46.79■■■■■ 5.08
IL1R1-201ENST00000409288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.69■■■■■ 5.06
IL1R1-201ENST00000409288 PRDM2Q13029 1718 aa46.67■■■■■ 5.06
IL1R1-201ENST00000409288 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.56■■■■■ 5.04
IL1R1-201ENST00000409288 SYNJ1O43426 1573 aa46.56■■■■■ 5.04
IL1R1-201ENST00000409288 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.37■■■■■ 5.01
IL1R1-201ENST00000409288 TOP2BQ02880 1626 aa46.35■■■■■ 5.01
IL1R1-201ENST00000409288 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
IL1R1-201ENST00000409288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.34■■■■■ 5.01
IL1R1-201ENST00000409288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.24■■■■■ 4.99
IL1R1-201ENST00000409288 CUX1P39880 1505 aa46.19■■■■■ 4.98
IL1R1-201ENST00000409288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.17■■■■■ 4.98
IL1R1-201ENST00000409288 SOGA1O94964 1423 aa46.17■■■■■ 4.98
IL1R1-201ENST00000409288 NESP48681 1621 aa46.13■■■■■ 4.98
IL1R1-201ENST00000409288 EEA1Q15075 1411 aa46.1■■■■■ 4.97
IL1R1-201ENST00000409288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.06■■■■■ 4.96
IL1R1-201ENST00000409288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.01■■■■■ 4.96
IL1R1-201ENST00000409288 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.8■■■■■ 4.92
IL1R1-201ENST00000409288 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.75■■■■■ 4.91
IL1R1-201ENST00000409288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.74■■■■■ 4.91
IL1R1-201ENST00000409288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.71■■■■■ 4.91
IL1R1-201ENST00000409288 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.66■■■■■ 4.9
IL1R1-201ENST00000409288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.64■■■■■ 4.9
IL1R1-201ENST00000409288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.63■■■■■ 4.9
IL1R1-201ENST00000409288 TOPBP1Q92547 1522 aa45.61■■■■■ 4.89
IL1R1-201ENST00000409288 KIF21BO75037 1637 aa45.57■■■■■ 4.88
IL1R1-201ENST00000409288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
IL1R1-201ENST00000409288 KIF27Q86VH2 1401 aa45.48■■■■■ 4.87
IL1R1-201ENST00000409288 GOLGA3Q08378 1498 aa45.47■■■■■ 4.87
IL1R1-201ENST00000409288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
IL1R1-201ENST00000409288 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.36■■■■■ 4.85
IL1R1-201ENST00000409288 CUX2O14529 1486 aa45.33■■■■■ 4.85
IL1R1-201ENST00000409288 PRXQ9BXM0 1461 aa45.27■■■■■ 4.84
IL1R1-201ENST00000409288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.25■■■■■ 4.83
IL1R1-201ENST00000409288 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.23■■■■■ 4.83
IL1R1-201ENST00000409288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.23■■■■■ 4.83
IL1R1-201ENST00000409288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.22■■■■■ 4.83
IL1R1-201ENST00000409288 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.18■■■■■ 4.82
IL1R1-201ENST00000409288 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
IL1R1-201ENST00000409288 WDR97A6NE52 1622 aa45.17■■■■■ 4.82
IL1R1-201ENST00000409288 CEP162Q5TB80 1403 aa45.14■■■■■ 4.82
IL1R1-201ENST00000409288 IGF1RP08069 1367 aa45.08■■■■■ 4.81
IL1R1-201ENST00000409288 WDR62O43379 1518 aa44.99■■■■■ 4.79
IL1R1-201ENST00000409288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
IL1R1-201ENST00000409288 ERCC6Q03468 1493 aa44.92■■■■■ 4.78
IL1R1-201ENST00000409288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.91■■■■■ 4.78
IL1R1-201ENST00000409288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
IL1R1-201ENST00000409288 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.83■■■■■ 4.77
IL1R1-201ENST00000409288 CUL7Q14999 1698 aa44.77■■■■■ 4.76
IL1R1-201ENST00000409288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
IL1R1-201ENST00000409288 CLIP1P30622 1438 aa44.74■■■■■ 4.75
IL1R1-201ENST00000409288 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.73■■■■■ 4.75
IL1R1-201ENST00000409288 IFT140Q96RY7 1462 aa44.65■■■■■ 4.74
IL1R1-201ENST00000409288 PBRM1Q86U86 1689 aa44.55■■■■■ 4.72
IL1R1-201ENST00000409288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.45■■■■■ 4.713e-6■■■■□ 21.7
IL1R1-201ENST00000409288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
IL1R1-201ENST00000409288 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.39■■■■■ 4.7
IL1R1-201ENST00000409288 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
IL1R1-201ENST00000409288 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.36■■■■■ 4.69
IL1R1-201ENST00000409288 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
IL1R1-201ENST00000409288 GRIN2BQ13224 1484 aa44.35■■■■■ 4.69
IL1R1-201ENST00000409288 ARAP1Q96P48 1450 aa44.34■■■■■ 4.69
IL1R1-201ENST00000409288 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.33■■■■■ 4.69
IL1R1-201ENST00000409288 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
IL1R1-201ENST00000409288 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.3■■■■■ 4.68
IL1R1-201ENST00000409288 ADAMTS12P58397 1594 aa44.3■■■■■ 4.68
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