RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340766.9

PPP1CC-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-202ENST00000340766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.65■■■■■ 8.42
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.78■■■■■ 7.16
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCC9O60706 1549 aa57.3■■■■■ 6.76
PPP1CC-202ENST00000340766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.62■■■■■ 6.65
PPP1CC-202ENST00000340766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.05■■■■■ 6.56
PPP1CC-202ENST00000340766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.94■■■■■ 6.55
PPP1CC-202ENST00000340766 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.86■■■■■ 6.53
PPP1CC-202ENST00000340766 NACADO15069 1562 aa55.85■■■■■ 6.53
PPP1CC-202ENST00000340766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.67■■■■■ 6.5
PPP1CC-202ENST00000340766 SCRIBQ14160 1630 aa54.6■■■■■ 6.33
PPP1CC-202ENST00000340766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.55■■■■■ 6.32
PPP1CC-202ENST00000340766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.07■■■■■ 6.25
PPP1CC-202ENST00000340766 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.94■■■■■ 6.23
PPP1CC-202ENST00000340766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.65■■■■■ 6.18
PPP1CC-202ENST00000340766 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.55■■■■■ 6
PPP1CC-202ENST00000340766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.43■■■■■ 5.98
PPP1CC-202ENST00000340766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.4■■■■■ 5.98
PPP1CC-202ENST00000340766 SMARCA4P51532 1647 aa52.33■■■■■ 5.97
PPP1CC-202ENST00000340766 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.17■■■■■ 5.94
PPP1CC-202ENST00000340766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.95■■■■■ 5.91
PPP1CC-202ENST00000340766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.92■■■■■ 5.9
PPP1CC-202ENST00000340766 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.78■■■■■ 5.88
PPP1CC-202ENST00000340766 SMARCA2P51531 1590 aa51.72■■■■■ 5.87
PPP1CC-202ENST00000340766 WIZO95785 1651 aa51.72■■■■■ 5.87
PPP1CC-202ENST00000340766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.68■■■■■ 5.86
PPP1CC-202ENST00000340766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.48■■■■■ 5.83
PPP1CC-202ENST00000340766 NCAPD3P42695 1498 aa51.46■■■■■ 5.83
PPP1CC-202ENST00000340766 HMGXB3Q12766 1538 aa51.4■■■■■ 5.82
PPP1CC-202ENST00000340766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.39■■■■■ 5.82
PPP1CC-202ENST00000340766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
PPP1CC-202ENST00000340766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.21■■■■■ 5.79
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.54■■■■■ 5.68
PPP1CC-202ENST00000340766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.01■■■■■ 5.6
PPP1CC-202ENST00000340766 CADPSQ9ULU8 1353 aa50■■■■■ 5.59
PPP1CC-202ENST00000340766 CFTRP13569 1480 aa49.98■■■■■ 5.59
PPP1CC-202ENST00000340766 NESP48681 1621 aa49.92■■■■■ 5.58
PPP1CC-202ENST00000340766 PRDM2Q13029 1718 aa49.91■■■■■ 5.58
PPP1CC-202ENST00000340766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.56■■■■■ 5.52
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.49■■■■■ 5.51
PPP1CC-202ENST00000340766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.48■■■■■ 5.51
PPP1CC-202ENST00000340766 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.34■■■■■ 5.49
PPP1CC-202ENST00000340766 ERCC6Q03468 1493 aa49.32■■■■■ 5.49
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCC8Q09428 1581 aa49.1■■■■■ 5.45
PPP1CC-202ENST00000340766 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.02■■■■■ 5.44
PPP1CC-202ENST00000340766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
PPP1CC-202ENST00000340766 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.94■■■■■ 5.43
PPP1CC-202ENST00000340766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
PPP1CC-202ENST00000340766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.91■■■■■ 5.42
PPP1CC-202ENST00000340766 CUX1P39880 1505 aa48.88■■■■■ 5.42
PPP1CC-202ENST00000340766 WDR62O43379 1518 aa48.86■■■■■ 5.41
PPP1CC-202ENST00000340766 SYNJ1O43426 1573 aa48.84■■■■■ 5.41
PPP1CC-202ENST00000340766 TOPBP1Q92547 1522 aa48.83■■■■■ 5.41
PPP1CC-202ENST00000340766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.83■■■■■ 5.41
PPP1CC-202ENST00000340766 TOP2BQ02880 1626 aa48.79■■■■■ 5.4
PPP1CC-202ENST00000340766 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.6■■■■■ 5.37
PPP1CC-202ENST00000340766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.54■■■■■ 5.36
PPP1CC-202ENST00000340766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.49■■■■■ 5.35
PPP1CC-202ENST00000340766 TRIM41Q8WV44 630 aa48.48■■■■■ 5.35
PPP1CC-202ENST00000340766 CUX2O14529 1486 aa48.4■■■■■ 5.34
PPP1CC-202ENST00000340766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
PPP1CC-202ENST00000340766 SOGA1O94964 1423 aa48.25■■■■■ 5.32
PPP1CC-202ENST00000340766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.24■■■■■ 5.31
PPP1CC-202ENST00000340766 IFT140Q96RY7 1462 aa48.23■■■■■ 5.31
PPP1CC-202ENST00000340766 WDR97A6NE52 1622 aa48.21■■■■■ 5.31
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.12■■■■■ 5.29
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.92■■■■■ 5.26
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.9■■■■■ 5.26
PPP1CC-202ENST00000340766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF27Q86VH2 1401 aa47.83■■■■■ 5.25
PPP1CC-202ENST00000340766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
PPP1CC-202ENST00000340766 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.76■■■■■ 5.24
PPP1CC-202ENST00000340766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.75■■■■■ 5.244e-8■■■■■ 43
PPP1CC-202ENST00000340766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.73■■■■■ 5.23
PPP1CC-202ENST00000340766 PBRM1Q86U86 1689 aa47.73■■■■■ 5.23
PPP1CC-202ENST00000340766 EEA1Q15075 1411 aa47.67■■■■■ 5.22
PPP1CC-202ENST00000340766 GRIN2BQ13224 1484 aa47.6■■■■■ 5.21
PPP1CC-202ENST00000340766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.58■■■■■ 5.21
PPP1CC-202ENST00000340766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
PPP1CC-202ENST00000340766 IGF1RP08069 1367 aa47.44■■■■■ 5.19
PPP1CC-202ENST00000340766 CUL7Q14999 1698 aa47.43■■■■■ 5.18
PPP1CC-202ENST00000340766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.4■■■■■ 5.18
PPP1CC-202ENST00000340766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.38■■■■■ 5.18
PPP1CC-202ENST00000340766 ADAMTS12P58397 1594 aa47.36■■■■■ 5.17
PPP1CC-202ENST00000340766 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.34■■■■■ 5.17
PPP1CC-202ENST00000340766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.23■■■■■ 5.15
PPP1CC-202ENST00000340766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.21■■■■■ 5.15
PPP1CC-202ENST00000340766 PRXQ9BXM0 1461 aa47.19■■■■■ 5.15
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF21BO75037 1637 aa47.16■■■■■ 5.14
PPP1CC-202ENST00000340766 SYNJ2O15056 1496 aa47.16■■■■■ 5.14
PPP1CC-202ENST00000340766 CHD1O14646 1710 aa47.11■■■■■ 5.13
PPP1CC-202ENST00000340766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.1■■■■■ 5.13
PPP1CC-202ENST00000340766 GRIN2AQ12879 1464 aa47.01■■■■■ 5.12
PPP1CC-202ENST00000340766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.97■■■■■ 5.11
PPP1CC-202ENST00000340766 FBLN2P98095 1184 aa46.93■■■■■ 5.1
PPP1CC-202ENST00000340766 GOLGA3Q08378 1498 aa46.92■■■■■ 5.1
PPP1CC-202ENST00000340766 CEP170Q5SW79 1584 aa46.76■■■■■ 5.08
PPP1CC-202ENST00000340766 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.76■■■■■ 5.08
PPP1CC-202ENST00000340766 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.75■■■■■ 5.07
PPP1CC-202ENST00000340766 NUP160Q12769 1436 aa46.73■■■■■ 5.07
PPP1CC-202ENST00000340766 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms