RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215904.6

PDXP-201, Transcript of pyridoxal phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDXP, Length 2,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXP-201ENST00000215904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.87■■■■■ 7.33
PDXP-201ENST00000215904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.53■■■■■ 6
PDXP-201ENST00000215904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.35■■■■■ 5.81
PDXP-201ENST00000215904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.39■■■■■ 5.66
PDXP-201ENST00000215904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.31■■■■■ 5.64
PDXP-201ENST00000215904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.94■■■■■ 5.58
PDXP-201ENST00000215904 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.32■■■■■ 5.49
PDXP-201ENST00000215904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
PDXP-201ENST00000215904 ABCC9O60706 1549 aa48.84■■■■■ 5.41
PDXP-201ENST00000215904 NACADO15069 1562 aa48.71■■■■■ 5.39
PDXP-201ENST00000215904 SCRIBQ14160 1630 aa48.51■■■■■ 5.36
PDXP-201ENST00000215904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.04■■■■■ 5.28
PDXP-201ENST00000215904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
PDXP-201ENST00000215904 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.46■■■■■ 5.19
PDXP-201ENST00000215904 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.26■■■■■ 5.16
PDXP-201ENST00000215904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.18■■■■■ 5.14
PDXP-201ENST00000215904 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.09■■■■■ 5.13
PDXP-201ENST00000215904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
PDXP-201ENST00000215904 WIZO95785 1651 aa46.76■■■■■ 5.08
PDXP-201ENST00000215904 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.66■■■■■ 5.06
PDXP-201ENST00000215904 SMARCA4P51532 1647 aa46.57■■■■■ 5.04
PDXP-201ENST00000215904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.3■■■■■ 5
PDXP-201ENST00000215904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
PDXP-201ENST00000215904 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.96■■■■■ 4.95
PDXP-201ENST00000215904 TRIM41Q8WV44 630 aa45.96■■■■■ 4.95
PDXP-201ENST00000215904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
PDXP-201ENST00000215904 SMARCA2P51531 1590 aa45.89■■■■■ 4.94
PDXP-201ENST00000215904 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.85■■■■■ 4.93
PDXP-201ENST00000215904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.7■■■■■ 4.91
PDXP-201ENST00000215904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.57■■■■■ 4.88
PDXP-201ENST00000215904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
PDXP-201ENST00000215904 ABCC8Q09428 1581 aa45.21■■■■■ 4.83
PDXP-201ENST00000215904 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
PDXP-201ENST00000215904 NCAPD3P42695 1498 aa44.99■■■■■ 4.79
PDXP-201ENST00000215904 HMGXB3Q12766 1538 aa44.99■■■■■ 4.79
PDXP-201ENST00000215904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.76
PDXP-201ENST00000215904 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.65■■■■■ 4.74
PDXP-201ENST00000215904 EEA1Q15075 1411 aa44.65■■■■■ 4.74
PDXP-201ENST00000215904 SOGA1O94964 1423 aa44.59■■■■■ 4.73
PDXP-201ENST00000215904 SYNJ1O43426 1573 aa44.57■■■■■ 4.73
PDXP-201ENST00000215904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.5■■■■■ 4.71
PDXP-201ENST00000215904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
PDXP-201ENST00000215904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.38■■■■■ 4.69
PDXP-201ENST00000215904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.34■■■■■ 4.69
PDXP-201ENST00000215904 TOP2BQ02880 1626 aa44.3■■■■■ 4.68
PDXP-201ENST00000215904 CFTRP13569 1480 aa44.29■■■■■ 4.68
PDXP-201ENST00000215904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.23■■■■■ 4.67
PDXP-201ENST00000215904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.22■■■■■ 4.67
PDXP-201ENST00000215904 HRCP23327 699 aa44.21■■■■■ 4.67
PDXP-201ENST00000215904 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.18■■■■■ 4.66
PDXP-201ENST00000215904 GOLGA3Q08378 1498 aa44.1■■■■■ 4.65
PDXP-201ENST00000215904 PRDM2Q13029 1718 aa44.07■■■■■ 4.65
PDXP-201ENST00000215904 KIF21BO75037 1637 aa44.04■■■■■ 4.64
PDXP-201ENST00000215904 CEP162Q5TB80 1403 aa44.01■■■■■ 4.64
PDXP-201ENST00000215904 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.99■■■■■ 4.63
PDXP-201ENST00000215904 CUX1P39880 1505 aa43.96■■■■■ 4.63
PDXP-201ENST00000215904 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.92■■■■■ 4.62
PDXP-201ENST00000215904 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
PDXP-201ENST00000215904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.63■■■■■ 4.58
PDXP-201ENST00000215904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
PDXP-201ENST00000215904 KIF27Q86VH2 1401 aa43.55■■■■■ 4.56
PDXP-201ENST00000215904 PRXQ9BXM0 1461 aa43.55■■■■■ 4.56
PDXP-201ENST00000215904 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
PDXP-201ENST00000215904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
PDXP-201ENST00000215904 CLIP1P30622 1438 aa43.43■■■■■ 4.54
PDXP-201ENST00000215904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.3■■■■■ 4.52
PDXP-201ENST00000215904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.26■■■■■ 4.52
PDXP-201ENST00000215904 NESP48681 1621 aa43.23■■■■■ 4.51
PDXP-201ENST00000215904 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.21■■■■■ 4.51
PDXP-201ENST00000215904 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.21■■■■■ 4.51
PDXP-201ENST00000215904 CUX2O14529 1486 aa43.21■■■■■ 4.51
PDXP-201ENST00000215904 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
PDXP-201ENST00000215904 IGF1RP08069 1367 aa43.1■■■■■ 4.49
PDXP-201ENST00000215904 TOPBP1Q92547 1522 aa43.08■■■■■ 4.49
PDXP-201ENST00000215904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
PDXP-201ENST00000215904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.95■■■■■ 4.47
PDXP-201ENST00000215904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.91■■■■■ 4.46
PDXP-201ENST00000215904 ARAP1Q96P48 1450 aa42.9■■■■■ 4.46
PDXP-201ENST00000215904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.88■■■■■ 4.46
PDXP-201ENST00000215904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.88■■■■■ 4.45
PDXP-201ENST00000215904 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
PDXP-201ENST00000215904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
PDXP-201ENST00000215904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.84■■■■■ 4.45
PDXP-201ENST00000215904 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
PDXP-201ENST00000215904 APLP2Q06481 763 aa42.75■■■■■ 4.43
PDXP-201ENST00000215904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.71■■■■■ 4.43
PDXP-201ENST00000215904 WDR97A6NE52 1622 aa42.7■■■■■ 4.43
PDXP-201ENST00000215904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.68■■■■■ 4.42
PDXP-201ENST00000215904 CUL7Q14999 1698 aa42.62■■■■■ 4.41
PDXP-201ENST00000215904 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
PDXP-201ENST00000215904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.51■■■■■ 4.4
PDXP-201ENST00000215904 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
PDXP-201ENST00000215904 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
PDXP-201ENST00000215904 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
PDXP-201ENST00000215904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
PDXP-201ENST00000215904 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.3■■■■■ 4.36
PDXP-201ENST00000215904 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.3■■■■■ 4.36
PDXP-201ENST00000215904 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
PDXP-201ENST00000215904 MAP3K1Q13233 1512 aa42.28■■■■■ 4.36
PDXP-201ENST00000215904 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.24■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms