RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.51■■■■■ 6.48
SH3BP2-221ENST00000511747 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.5■■■■■ 5.2
SH3BP2-221ENST00000511747 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.97■■■■■ 5.11
SH3BP2-221ENST00000511747 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
SH3BP2-221ENST00000511747 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.06■■■■■ 4.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.61■■■■■ 4.89
SH3BP2-221ENST00000511747 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.54■■■■■ 4.88
SH3BP2-221ENST00000511747 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.38■■■■■ 4.85
SH3BP2-221ENST00000511747 HRCP23327 699 aa44.6■■■■■ 4.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.44■■■■■ 4.7
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCC9O60706 1549 aa44.32■■■■■ 4.69
SH3BP2-221ENST00000511747 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.28■■■■■ 4.68
SH3BP2-221ENST00000511747 SCRIBQ14160 1630 aa44.1■■■■■ 4.65
SH3BP2-221ENST00000511747 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
SH3BP2-221ENST00000511747 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM41Q8WV44 630 aa43.58■■■■■ 4.57
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
SH3BP2-221ENST00000511747 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.55■■■■■ 4.56
SH3BP2-221ENST00000511747 NACADO15069 1562 aa43.48■■■■■ 4.55
SH3BP2-221ENST00000511747 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.3■■■■■ 4.52
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.15■■■■■ 4.5
SH3BP2-221ENST00000511747 WIZO95785 1651 aa42.9■■■■■ 4.46
SH3BP2-221ENST00000511747 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.79■■■■■ 4.44
SH3BP2-221ENST00000511747 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
SH3BP2-221ENST00000511747 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
SH3BP2-221ENST00000511747 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.28■■■■■ 4.36
SH3BP2-221ENST00000511747 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
SH3BP2-221ENST00000511747 SMARCA4P51532 1647 aa42.17■■■■■ 4.34
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.14■■■■■ 4.34
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCC8Q09428 1581 aa42.04■■■■■ 4.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SMARCA2P51531 1590 aa42.01■■■■■ 4.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.31e-6■■□□□ 13.4
SH3BP2-221ENST00000511747 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.84■■■■■ 4.29
SH3BP2-221ENST00000511747 SOGA1O94964 1423 aa41.77■■■■■ 4.28
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
SH3BP2-221ENST00000511747 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.27
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP162Q5TB80 1403 aa41.68■■■■■ 4.26
SH3BP2-221ENST00000511747 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
SH3BP2-221ENST00000511747 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.64■■■■■ 4.26
SH3BP2-221ENST00000511747 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.63■■■■■ 4.25
SH3BP2-221ENST00000511747 EEA1Q15075 1411 aa41.6■■■■■ 4.25
SH3BP2-221ENST00000511747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.53■■■■■ 4.24
SH3BP2-221ENST00000511747 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.38■■■■■ 4.22
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA3Q08378 1498 aa41.3■■■■■ 4.2
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SH3BP2-221ENST00000511747 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.1■■■■■ 4.17
SH3BP2-221ENST00000511747 SYNJ1O43426 1573 aa41.09■■■■■ 4.17
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.05■■■■■ 4.16
SH3BP2-221ENST00000511747 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
SH3BP2-221ENST00000511747 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
SH3BP2-221ENST00000511747 KIF21BO75037 1637 aa40.94■■■■■ 4.14
SH3BP2-221ENST00000511747 CLIP1P30622 1438 aa40.87■■■■■ 4.13
SH3BP2-221ENST00000511747 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
SH3BP2-221ENST00000511747 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.73■■■■■ 4.11
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.71■■■■■ 4.11
SH3BP2-221ENST00000511747 NEUROD1Q13562 356 aa40.7■■■■■ 4.11
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
SH3BP2-221ENST00000511747 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
SH3BP2-221ENST00000511747 APLP2Q06481 763 aa40.61■■■■■ 4.09
SH3BP2-221ENST00000511747 TOP2BQ02880 1626 aa40.58■■■■■ 4.09
SH3BP2-221ENST00000511747 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SH3BP2-221ENST00000511747 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.38■■■■■ 4.05
SH3BP2-221ENST00000511747 PRXQ9BXM0 1461 aa40.32■■■■■ 4.05
SH3BP2-221ENST00000511747 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.31■■■■■ 4.04
SH3BP2-221ENST00000511747 NCAPD3P42695 1498 aa40.28■■■■■ 4.04
SH3BP2-221ENST00000511747 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.28■■■■■ 4.04
SH3BP2-221ENST00000511747 HMGXB3Q12766 1538 aa40.21■■■■■ 4.03
SH3BP2-221ENST00000511747 CUX1P39880 1505 aa40.14■■■■■ 4.02
SH3BP2-221ENST00000511747 ARAP1Q96P48 1450 aa40.13■■■■■ 4.01
SH3BP2-221ENST00000511747 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
SH3BP2-221ENST00000511747 MIER1Q8N108 512 aa40.06■■■■■ 4
SH3BP2-221ENST00000511747 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
SH3BP2-221ENST00000511747 CFTRP13569 1480 aa40.02■■■■■ 4
SH3BP2-221ENST00000511747 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.96■■■■□ 3.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
SH3BP2-221ENST00000511747 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.78■■■■□ 3.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.77■■■■□ 3.96
SH3BP2-221ENST00000511747 IGF1RP08069 1367 aa39.67■■■■□ 3.94
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.66■■■■□ 3.94
SH3BP2-221ENST00000511747 CUX2O14529 1486 aa39.63■■■■□ 3.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.56■■■■□ 3.92
SH3BP2-221ENST00000511747 PRDM2Q13029 1718 aa39.51■■■■□ 3.91
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGAEP38570 1179 aa39.5■■■■□ 3.91
SH3BP2-221ENST00000511747 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.49■■■■□ 3.91
SH3BP2-221ENST00000511747 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.41■■■■□ 3.9
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP3K1Q13233 1512 aa39.37■■■■□ 3.89
SH3BP2-221ENST00000511747 TIAM1Q13009 1591 aa39.35■■■■□ 3.89
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.32■■■■□ 3.88
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.26■■■■□ 3.88
SH3BP2-221ENST00000511747 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.2■■■■□ 3.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.19■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms