RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75.29■■■■■ 9.64
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CMTM4-202ENST00000394106 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63.39■■■■■ 7.74
CMTM4-202ENST00000394106 DCAF8L2P0C7V8 631 aa63.21■■■■■ 7.71
CMTM4-202ENST00000394106 NACADO15069 1562 aa63.18■■■■■ 7.71
CMTM4-202ENST00000394106 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.62■■■■■ 7.61
CMTM4-202ENST00000394106 MYO15BQ96JP2 1530 aa62.6■■■■■ 7.61
CMTM4-202ENST00000394106 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.2■■■■■ 7.55
CMTM4-202ENST00000394106 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61.99■■■■■ 7.51
CMTM4-202ENST00000394106 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61.76■■■■■ 7.48
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CMTM4-202ENST00000394106 SCRIBQ14160 1630 aa61.3■■■■■ 7.4
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CMTM4-202ENST00000394106 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.71■■■■■ 7.31
CMTM4-202ENST00000394106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59.9■■■■■ 7.18
CMTM4-202ENST00000394106 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.79■■■■■ 7.16
CMTM4-202ENST00000394106 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.45■■■■■ 7.11
CMTM4-202ENST00000394106 SMARCA4P51532 1647 aa58.53■■■■■ 6.96
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CMTM4-202ENST00000394106 NCAPD3P42695 1498 aa58.29■■■■■ 6.92
CMTM4-202ENST00000394106 SMARCA2P51531 1590 aa58.2■■■■■ 6.91
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CMTM4-202ENST00000394106 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.9■■■■■ 6.86
CMTM4-202ENST00000394106 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.83■■■■■ 6.85
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CMTM4-202ENST00000394106 ERCC6Q03468 1493 aa57.05■■■■■ 6.72
CMTM4-202ENST00000394106 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56.84■■■■■ 6.69
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CMTM4-202ENST00000394106 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.48■■■■■ 6.63
CMTM4-202ENST00000394106 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.43■■■■■ 6.62
CMTM4-202ENST00000394106 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56.3■■■■■ 6.6
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CMTM4-202ENST00000394106 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.1■■■■■ 6.57
CMTM4-202ENST00000394106 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.99■■■■■ 6.55
CMTM4-202ENST00000394106 MRC2Q9UBG0 1479 aa55.95■■■■■ 6.55
CMTM4-202ENST00000394106 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.95■■■■■ 6.55
CMTM4-202ENST00000394106 WDR62O43379 1518 aa55.77■■■■■ 6.52
CMTM4-202ENST00000394106 PRDM2Q13029 1718 aa55.76■■■■■ 6.52
CMTM4-202ENST00000394106 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55.71■■■■■ 6.51
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CMTM4-202ENST00000394106 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55.46■■■■■ 6.47
CMTM4-202ENST00000394106 TOPBP1Q92547 1522 aa55.05■■■■■ 6.4
CMTM4-202ENST00000394106 ABCC8Q09428 1581 aa54.97■■■■■ 6.39
CMTM4-202ENST00000394106 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.93■■■■■ 6.38
CMTM4-202ENST00000394106 IFT140Q96RY7 1462 aa54.78■■■■■ 6.36
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54.6■■■■■ 6.33
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CMTM4-202ENST00000394106 CUX1P39880 1505 aa54.49■■■■■ 6.31
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CMTM4-202ENST00000394106 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54.35■■■■■ 6.29
CMTM4-202ENST00000394106 SOGA1O94964 1423 aa54.32■■■■■ 6.29
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CMTM4-202ENST00000394106 OSCARQ8IYS5 282 aa54.13■■■■■ 6.26
CMTM4-202ENST00000394106 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54.09■■■■■ 6.25
CMTM4-202ENST00000394106 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53.97■■■■■ 6.23
CMTM4-202ENST00000394106 WDR97A6NE52 1622 aa53.95■■■■■ 6.23
CMTM4-202ENST00000394106 TOP2BQ02880 1626 aa53.9■■■■■ 6.22
CMTM4-202ENST00000394106 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.9■■■■■ 6.22
CMTM4-202ENST00000394106 SYNJ1O43426 1573 aa53.89■■■■■ 6.22
CMTM4-202ENST00000394106 CHD1O14646 1710 aa53.8■■■■■ 6.2
CMTM4-202ENST00000394106 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.78■■■■■ 6.2
CMTM4-202ENST00000394106 FBLN2P98095 1184 aa53.75■■■■■ 6.2
CMTM4-202ENST00000394106 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.74■■■■■ 6.19
CMTM4-202ENST00000394106 GRIN2BQ13224 1484 aa53.72■■■■■ 6.19
CMTM4-202ENST00000394106 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.69■■■■■ 6.19
CMTM4-202ENST00000394106 PBRM1Q86U86 1689 aa53.63■■■■■ 6.18
CMTM4-202ENST00000394106 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.63■■■■■ 6.18
CMTM4-202ENST00000394106 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.61■■■■■ 6.17
CMTM4-202ENST00000394106 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53.48■■■■■ 6.15
CMTM4-202ENST00000394106 SYNJ2O15056 1496 aa53.42■■■■■ 6.14
CMTM4-202ENST00000394106 TRIM41Q8WV44 630 aa53.4■■■■■ 6.14
CMTM4-202ENST00000394106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.35■■■■■ 6.13
CMTM4-202ENST00000394106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53.35■■■■■ 6.13
CMTM4-202ENST00000394106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.35■■■■■ 6.13
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGEF11O15085 1522 aa53.27■■■■■ 6.12
CMTM4-202ENST00000394106 ADAMTS12P58397 1594 aa53.16■■■■■ 6.1
CMTM4-202ENST00000394106 CLASP1Q7Z460 1538 aa53.14■■■■■ 6.1
CMTM4-202ENST00000394106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa53.13■■■■■ 6.1
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CMTM4-202ENST00000394106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53.03■■■■■ 6.08
CMTM4-202ENST00000394106 KIF27Q86VH2 1401 aa52.88■■■■■ 6.06
CMTM4-202ENST00000394106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52.83■■■■■ 6.05
CMTM4-202ENST00000394106 CEP170Q5SW79 1584 aa52.81■■■■■ 6.05
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CMTM4-202ENST00000394106 NUP160Q12769 1436 aa52.79■■■■■ 6.04
CMTM4-202ENST00000394106 IGF1RP08069 1367 aa52.7■■■■■ 6.03
CMTM4-202ENST00000394106 CUL7Q14999 1698 aa52.6■■■■■ 6.01
CMTM4-202ENST00000394106 SHROOM2Q13796 1616 aa52.45■■■■■ 5.99
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CMTM4-202ENST00000394106 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.39■■■■■ 5.98
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