RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366621.7

KCNK1-202, Transcript of potassium two pore domain channel subfamily K member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNK1, Length 2,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK1-202ENST00000366621 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.7■■■■■ 7.79
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KCNK1-202ENST00000366621 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.78■■■■■ 6.04
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KCNK1-202ENST00000366621 SCRIBQ14160 1630 aa51.13■■■■■ 5.78
KCNK1-202ENST00000366621 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.08■■■■■ 5.77
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KCNK1-202ENST00000366621 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.14■■■■■ 5.46
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KCNK1-202ENST00000366621 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.26■■■■■ 5.32
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KCNK1-202ENST00000366621 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.1■■■■■ 5.29
KCNK1-202ENST00000366621 SMARCA2P51531 1590 aa48.01■■■■■ 5.28
KCNK1-202ENST00000366621 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.9■■■■■ 5.26
KCNK1-202ENST00000366621 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
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KCNK1-202ENST00000366621 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.61■■■■■ 5.05
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KCNK1-202ENST00000366621 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.54■■■■■ 5.04
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KCNK1-202ENST00000366621 PRDM2Q13029 1718 aa46.33■■■■■ 5.01
KCNK1-202ENST00000366621 SOGA1O94964 1423 aa46.18■■■■■ 4.98
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KCNK1-202ENST00000366621 NESP48681 1621 aa46.1■■■■■ 4.97
KCNK1-202ENST00000366621 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.09■■■■■ 4.97
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KCNK1-202ENST00000366621 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.96■■■■■ 4.95
KCNK1-202ENST00000366621 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.94■■■■■ 4.94
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KCNK1-202ENST00000366621 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.62■■■■■ 4.89
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KCNK1-202ENST00000366621 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.52■■■■■ 4.88
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KCNK1-202ENST00000366621 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.47■■■■■ 4.87
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KCNK1-202ENST00000366621 KIF21BO75037 1637 aa45.36■■■■■ 4.85
KCNK1-202ENST00000366621 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
KCNK1-202ENST00000366621 CUX2O14529 1486 aa45.28■■■■■ 4.84
KCNK1-202ENST00000366621 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
KCNK1-202ENST00000366621 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.26■■■■■ 4.84
KCNK1-202ENST00000366621 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.2■■■■■ 4.83
KCNK1-202ENST00000366621 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.2■■■■■ 4.83
KCNK1-202ENST00000366621 PRXQ9BXM0 1461 aa45.13■■■■■ 4.82
KCNK1-202ENST00000366621 CEP162Q5TB80 1403 aa45.11■■■■■ 4.81
KCNK1-202ENST00000366621 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.08■■■■■ 4.81
KCNK1-202ENST00000366621 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.02■■■■■ 4.8
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KCNK1-202ENST00000366621 WDR97A6NE52 1622 aa44.9■■■■■ 4.78
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KCNK1-202ENST00000366621 WDR62O43379 1518 aa44.77■■■■■ 4.76
KCNK1-202ENST00000366621 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
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KCNK1-202ENST00000366621 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.7■■■■■ 4.75
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KCNK1-202ENST00000366621 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
KCNK1-202ENST00000366621 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.56■■■■■ 4.72
KCNK1-202ENST00000366621 CUL7Q14999 1698 aa44.55■■■■■ 4.72
KCNK1-202ENST00000366621 IFT140Q96RY7 1462 aa44.49■■■■■ 4.71
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KCNK1-202ENST00000366621 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
KCNK1-202ENST00000366621 PBRM1Q86U86 1689 aa44.35■■■■■ 4.69
KCNK1-202ENST00000366621 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.31■■■■■ 4.68
KCNK1-202ENST00000366621 ARAP1Q96P48 1450 aa44.26■■■■■ 4.68
KCNK1-202ENST00000366621 GRIN2BQ13224 1484 aa44.22■■■■■ 4.67
KCNK1-202ENST00000366621 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.22■■■■■ 4.67
KCNK1-202ENST00000366621 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
KCNK1-202ENST00000366621 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.12■■■■■ 4.65
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