RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371421.8

ARRDC1-201, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-201ENST00000371421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.58■■■■■ 8.41
ARRDC1-201ENST00000371421 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.57■■■■■ 7.13
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCC9O60706 1549 aa57.41■■■■■ 6.78
ARRDC1-201ENST00000371421 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.49■■■■■ 6.63
ARRDC1-201ENST00000371421 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.21■■■■■ 6.59
ARRDC1-201ENST00000371421 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.95■■■■■ 6.55
ARRDC1-201ENST00000371421 NACADO15069 1562 aa55.82■■■■■ 6.53
ARRDC1-201ENST00000371421 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.81■■■■■ 6.52
ARRDC1-201ENST00000371421 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.63■■■■■ 6.5
ARRDC1-201ENST00000371421 SCRIBQ14160 1630 aa54.48■■■■■ 6.31
ARRDC1-201ENST00000371421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.32■■■■■ 6.29
ARRDC1-201ENST00000371421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.08■■■■■ 6.25
ARRDC1-201ENST00000371421 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.89■■■■■ 6.22
ARRDC1-201ENST00000371421 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.87■■■■■ 6.212e-6■□□□□ 9.6
ARRDC1-201ENST00000371421 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.55■■■■■ 6
ARRDC1-201ENST00000371421 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.41■■■■■ 5.98
ARRDC1-201ENST00000371421 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.31■■■■■ 5.96
ARRDC1-201ENST00000371421 SMARCA4P51532 1647 aa52.2■■■■■ 5.95
ARRDC1-201ENST00000371421 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.11■■■■■ 5.93
ARRDC1-201ENST00000371421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.94■■■■■ 5.91
ARRDC1-201ENST00000371421 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
ARRDC1-201ENST00000371421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.81■■■■■ 5.88
ARRDC1-201ENST00000371421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.7■■■■■ 5.87
ARRDC1-201ENST00000371421 SMARCA2P51531 1590 aa51.67■■■■■ 5.86
ARRDC1-201ENST00000371421 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.67■■■■■ 5.86
ARRDC1-201ENST00000371421 WIZO95785 1651 aa51.58■■■■■ 5.85
ARRDC1-201ENST00000371421 NCAPD3P42695 1498 aa51.52■■■■■ 5.84
ARRDC1-201ENST00000371421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
ARRDC1-201ENST00000371421 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
ARRDC1-201ENST00000371421 HMGXB3Q12766 1538 aa51.32■■■■■ 5.81
ARRDC1-201ENST00000371421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.09■■■■■ 5.77
ARRDC1-201ENST00000371421 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.52■■■■■ 5.68
ARRDC1-201ENST00000371421 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.11■■■■■ 5.61
ARRDC1-201ENST00000371421 CFTRP13569 1480 aa50■■■■■ 5.59
ARRDC1-201ENST00000371421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.98■■■■■ 5.59
ARRDC1-201ENST00000371421 NESP48681 1621 aa49.97■■■■■ 5.59
ARRDC1-201ENST00000371421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.66■■■■■ 5.54
ARRDC1-201ENST00000371421 PRDM2Q13029 1718 aa49.6■■■■■ 5.53
ARRDC1-201ENST00000371421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.51■■■■■ 5.52
ARRDC1-201ENST00000371421 ERCC6Q03468 1493 aa49.42■■■■■ 5.5
ARRDC1-201ENST00000371421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.36■■■■■ 5.49
ARRDC1-201ENST00000371421 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.34■■■■■ 5.49
ARRDC1-201ENST00000371421 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.05■■■■■ 5.44
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCC8Q09428 1581 aa48.97■■■■■ 5.43
ARRDC1-201ENST00000371421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.93■■■■■ 5.42
ARRDC1-201ENST00000371421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
ARRDC1-201ENST00000371421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
ARRDC1-201ENST00000371421 WDR62O43379 1518 aa48.83■■■■■ 5.41
ARRDC1-201ENST00000371421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.82■■■■■ 5.41
ARRDC1-201ENST00000371421 CUX1P39880 1505 aa48.81■■■■■ 5.4
ARRDC1-201ENST00000371421 TOPBP1Q92547 1522 aa48.81■■■■■ 5.4
ARRDC1-201ENST00000371421 SYNJ1O43426 1573 aa48.68■■■■■ 5.38
ARRDC1-201ENST00000371421 TOP2BQ02880 1626 aa48.65■■■■■ 5.38
ARRDC1-201ENST00000371421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.61■■■■■ 5.37
ARRDC1-201ENST00000371421 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.59■■■■■ 5.37
ARRDC1-201ENST00000371421 TRIM41Q8WV44 630 aa48.55■■■■■ 5.36
ARRDC1-201ENST00000371421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.5■■■■■ 5.35
ARRDC1-201ENST00000371421 CUX2O14529 1486 aa48.49■■■■■ 5.35
ARRDC1-201ENST00000371421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.47■■■■■ 5.35
ARRDC1-201ENST00000371421 SOGA1O94964 1423 aa48.33■■■■■ 5.33
ARRDC1-201ENST00000371421 IFT140Q96RY7 1462 aa48.26■■■■■ 5.32
ARRDC1-201ENST00000371421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.26■■■■■ 5.32
ARRDC1-201ENST00000371421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.08■■■■■ 5.29
ARRDC1-201ENST00000371421 WDR97A6NE52 1622 aa47.97■■■■■ 5.27
ARRDC1-201ENST00000371421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.95■■■■■ 5.27
ARRDC1-201ENST00000371421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.27
ARRDC1-201ENST00000371421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.85■■■■■ 5.252e-10■■■■■ 40
ARRDC1-201ENST00000371421 KIF27Q86VH2 1401 aa47.83■■■■■ 5.25
ARRDC1-201ENST00000371421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
ARRDC1-201ENST00000371421 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.77■■■■■ 5.24
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.75■■■■■ 5.23
ARRDC1-201ENST00000371421 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.68■■■■■ 5.22
ARRDC1-201ENST00000371421 GRIN2BQ13224 1484 aa47.62■■■■■ 5.21
ARRDC1-201ENST00000371421 EEA1Q15075 1411 aa47.58■■■■■ 5.21
ARRDC1-201ENST00000371421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.53■■■■■ 5.2
ARRDC1-201ENST00000371421 IGF1RP08069 1367 aa47.52■■■■■ 5.2
ARRDC1-201ENST00000371421 PBRM1Q86U86 1689 aa47.52■■■■■ 5.2
ARRDC1-201ENST00000371421 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.51■■■■■ 5.2
ARRDC1-201ENST00000371421 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.43■■■■■ 5.18
ARRDC1-201ENST00000371421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.39■■■■■ 5.18
ARRDC1-201ENST00000371421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
ARRDC1-201ENST00000371421 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.27■■■■■ 5.16
ARRDC1-201ENST00000371421 CUL7Q14999 1698 aa47.26■■■■■ 5.16
ARRDC1-201ENST00000371421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.25■■■■■ 5.16
ARRDC1-201ENST00000371421 ADAMTS12P58397 1594 aa47.22■■■■■ 5.15
ARRDC1-201ENST00000371421 SYNJ2O15056 1496 aa47.18■■■■■ 5.14
ARRDC1-201ENST00000371421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
ARRDC1-201ENST00000371421 FBLN2P98095 1184 aa47.15■■■■■ 5.14
ARRDC1-201ENST00000371421 PRXQ9BXM0 1461 aa47.14■■■■■ 5.14
ARRDC1-201ENST00000371421 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.07■■■■■ 5.13
ARRDC1-201ENST00000371421 GRIN2AQ12879 1464 aa47■■■■■ 5.11
ARRDC1-201ENST00000371421 CHD1O14646 1710 aa46.96■■■■■ 5.11
ARRDC1-201ENST00000371421 KIF21BO75037 1637 aa46.95■■■■■ 5.11
ARRDC1-201ENST00000371421 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.82■■■■■ 5.09
ARRDC1-201ENST00000371421 GOLGA3Q08378 1498 aa46.81■■■■■ 5.08
ARRDC1-201ENST00000371421 OSCARQ8IYS5 282 aa46.77■■■■■ 5.08
ARRDC1-201ENST00000371421 NUP160Q12769 1436 aa46.75■■■■■ 5.07
ARRDC1-201ENST00000371421 CEP170Q5SW79 1584 aa46.69■■■■■ 5.07
ARRDC1-201ENST00000371421 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms