RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.87■■■■■ 7.82
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.73■■■■■ 6.19
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.03■■■■■ 6.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.92■■■■■ 6.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 NACADO15069 1562 aa52.66■■■■■ 6.02
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.58■■■■■ 6.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.54■■■■■ 6
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CTDNEP1-210ENST00000574322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.28■■■■■ 5.8
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CTDNEP1-210ENST00000574322 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.9■■■■■ 5.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.55■■■■■ 5.52
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.32■■■■■ 5.49
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.14■■■■■ 5.46
CTDNEP1-210ENST00000574322 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.12■■■■■ 5.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 WIZO95785 1651 aa48.9■■■■■ 5.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.77■■■■■ 5.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMARCA2P51531 1590 aa48.73■■■■■ 5.39
CTDNEP1-210ENST00000574322 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.68■■■■■ 5.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCAPD3P42695 1498 aa48.61■■■■■ 5.37
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CTDNEP1-210ENST00000574322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.44■■■■■ 5.34
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.27■■■■■ 5.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 NESP48681 1621 aa47.24■■■■■ 5.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.18■■■■■ 5.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFTRP13569 1480 aa47.13■■■■■ 5.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCC8Q09428 1581 aa46.98■■■■■ 5.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.89■■■■■ 5.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.73■■■■■ 5.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDM2Q13029 1718 aa46.73■■■■■ 5.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.7■■■■■ 5.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.63■■■■■ 5.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.59■■■■■ 5.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.52■■■■■ 5.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNJ1O43426 1573 aa46.49■■■■■ 5.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.35■■■■■ 5.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOP2BQ02880 1626 aa46.33■■■■■ 5.01
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.74■■■■■ 4.91
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.54■■■■■ 4.88
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF27Q86VH2 1401 aa45.5■■■■■ 4.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.29■■■■■ 4.84
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP162Q5TB80 1403 aa45.25■■■■■ 4.84
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.25■■■■■ 4.83
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR97A6NE52 1622 aa45.23■■■■■ 4.83
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.05■■■■■ 4.8
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.03■■■■■ 4.8
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CLIP1P30622 1438 aa44.84■■■■■ 4.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.77■■■■■ 4.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.69■■■■■ 4.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBLN2P98095 1184 aa44.56■■■■■ 4.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.56■■■■■ 4.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAMTS12P58397 1594 aa44.55■■■■■ 4.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNJ2O15056 1496 aa44.54■■■■■ 4.72
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