RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293662.8

GRASP-201, Transcript of general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRASP, Length 1,933 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRASP-201ENST00000293662 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.66■■■■■ 7.3
GRASP-201ENST00000293662 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.37■■■■■ 5.97
GRASP-201ENST00000293662 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.17■■■■■ 5.78
GRASP-201ENST00000293662 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.2■■■■■ 5.63
GRASP-201ENST00000293662 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.19■■■■■ 5.63
GRASP-201ENST00000293662 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.73■■■■■ 5.55
GRASP-201ENST00000293662 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.2■■■■■ 5.47
GRASP-201ENST00000293662 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
GRASP-201ENST00000293662 NACADO15069 1562 aa48.55■■■■■ 5.36
GRASP-201ENST00000293662 ABCC9O60706 1549 aa48.53■■■■■ 5.36
GRASP-201ENST00000293662 SCRIBQ14160 1630 aa48.29■■■■■ 5.32
GRASP-201ENST00000293662 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.86■■■■■ 5.25
GRASP-201ENST00000293662 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.48■■■■■ 5.19
GRASP-201ENST00000293662 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.39■■■■■ 5.18
GRASP-201ENST00000293662 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.02■■■■■ 5.12
GRASP-201ENST00000293662 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.9■■■■■ 5.1
GRASP-201ENST00000293662 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.89■■■■■ 5.1
GRASP-201ENST00000293662 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
GRASP-201ENST00000293662 WIZO95785 1651 aa46.55■■■■■ 5.04
GRASP-201ENST00000293662 SMARCA4P51532 1647 aa46.38■■■■■ 5.02
GRASP-201ENST00000293662 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.38■■■■■ 5.02
GRASP-201ENST00000293662 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
GRASP-201ENST00000293662 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.99■■■■■ 4.95
GRASP-201ENST00000293662 TRIM41Q8WV44 630 aa45.91■■■■■ 4.94
GRASP-201ENST00000293662 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.8■■■■■ 4.92
GRASP-201ENST00000293662 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
GRASP-201ENST00000293662 SMARCA2P51531 1590 aa45.72■■■■■ 4.91
GRASP-201ENST00000293662 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.68■■■■■ 4.9
GRASP-201ENST00000293662 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.59■■■■■ 4.89
GRASP-201ENST00000293662 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.37■■■■■ 4.85
GRASP-201ENST00000293662 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
GRASP-201ENST00000293662 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
GRASP-201ENST00000293662 ABCC8Q09428 1581 aa45.03■■■■■ 4.8
GRASP-201ENST00000293662 HMGXB3Q12766 1538 aa44.83■■■■■ 4.77
GRASP-201ENST00000293662 NCAPD3P42695 1498 aa44.81■■■■■ 4.76
GRASP-201ENST00000293662 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.67■■■■■ 4.74
GRASP-201ENST00000293662 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.67■■■■■ 4.74
GRASP-201ENST00000293662 EEA1Q15075 1411 aa44.66■■■■■ 4.74
GRASP-201ENST00000293662 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
GRASP-201ENST00000293662 SOGA1O94964 1423 aa44.43■■■■■ 4.7
GRASP-201ENST00000293662 SYNJ1O43426 1573 aa44.4■■■■■ 4.7
GRASP-201ENST00000293662 HRCP23327 699 aa44.33■■■■■ 4.69
GRASP-201ENST00000293662 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.33■■■■■ 4.69
GRASP-201ENST00000293662 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.28■■■■■ 4.68
GRASP-201ENST00000293662 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.18■■■■■ 4.66
GRASP-201ENST00000293662 TOP2BQ02880 1626 aa44.17■■■■■ 4.66
GRASP-201ENST00000293662 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.15■■■■■ 4.66
GRASP-201ENST00000293662 CFTRP13569 1480 aa44.11■■■■■ 4.65
GRASP-201ENST00000293662 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.1■■■■■ 4.65
GRASP-201ENST00000293662 GOLGA3Q08378 1498 aa44.04■■■■■ 4.64
GRASP-201ENST00000293662 KIF21BO75037 1637 aa43.97■■■■■ 4.63
GRASP-201ENST00000293662 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.95■■■■■ 4.63
GRASP-201ENST00000293662 CEP162Q5TB80 1403 aa43.95■■■■■ 4.63
GRASP-201ENST00000293662 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.94■■■■■ 4.62
GRASP-201ENST00000293662 PRDM2Q13029 1718 aa43.93■■■■■ 4.62
GRASP-201ENST00000293662 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
GRASP-201ENST00000293662 CUX1P39880 1505 aa43.77■■■■■ 4.6
GRASP-201ENST00000293662 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.73■■■■■ 4.59
GRASP-201ENST00000293662 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.49■■■■■ 4.55
GRASP-201ENST00000293662 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.49■■■■■ 4.55
GRASP-201ENST00000293662 KIF27Q86VH2 1401 aa43.46■■■■■ 4.55
GRASP-201ENST00000293662 PRXQ9BXM0 1461 aa43.43■■■■■ 4.54
GRASP-201ENST00000293662 CLIP1P30622 1438 aa43.37■■■■■ 4.53
GRASP-201ENST00000293662 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
GRASP-201ENST00000293662 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
GRASP-201ENST00000293662 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.24■■■■■ 4.51
GRASP-201ENST00000293662 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.16■■■■■ 4.5
GRASP-201ENST00000293662 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.13■■■■■ 4.49
GRASP-201ENST00000293662 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.1■■■■■ 4.49
GRASP-201ENST00000293662 CUX2O14529 1486 aa43.07■■■■■ 4.48
GRASP-201ENST00000293662 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.06■■■■■ 4.48
GRASP-201ENST00000293662 IGF1RP08069 1367 aa42.95■■■■■ 4.47
GRASP-201ENST00000293662 NESP48681 1621 aa42.94■■■■■ 4.46
GRASP-201ENST00000293662 TOPBP1Q92547 1522 aa42.9■■■■■ 4.46
GRASP-201ENST00000293662 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.8■■■■■ 4.44
GRASP-201ENST00000293662 APLP2Q06481 763 aa42.79■■■■■ 4.44
GRASP-201ENST00000293662 ARAP1Q96P48 1450 aa42.79■■■■■ 4.44
GRASP-201ENST00000293662 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
GRASP-201ENST00000293662 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.76■■■■■ 4.44
GRASP-201ENST00000293662 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.75■■■■■ 4.43
GRASP-201ENST00000293662 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
GRASP-201ENST00000293662 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
GRASP-201ENST00000293662 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
GRASP-201ENST00000293662 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.62■■■■■ 4.41
GRASP-201ENST00000293662 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.59■■■■■ 4.41
GRASP-201ENST00000293662 CUL7Q14999 1698 aa42.52■■■■■ 4.4
GRASP-201ENST00000293662 WDR97A6NE52 1622 aa42.52■■■■■ 4.4
GRASP-201ENST00000293662 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
GRASP-201ENST00000293662 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
GRASP-201ENST00000293662 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.46■■■■■ 4.39
GRASP-201ENST00000293662 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.43■■■■■ 4.38
GRASP-201ENST00000293662 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.34■■■■■ 4.37
GRASP-201ENST00000293662 MAP3K1Q13233 1512 aa42.26■■■■■ 4.36
GRASP-201ENST00000293662 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.21■■■■■ 4.35
GRASP-201ENST00000293662 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.19■■■■■ 4.34
GRASP-201ENST00000293662 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.18■■■■■ 4.34
GRASP-201ENST00000293662 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.17■■■■■ 4.34
GRASP-201ENST00000293662 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
GRASP-201ENST00000293662 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
GRASP-201ENST00000293662 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.4 ms