RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.38■■■■■ 7.1
CERS1-201ENST00000429504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.13■■■■■ 5.78
CERS1-201ENST00000429504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.17■■■■■ 5.62
CERS1-201ENST00000429504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.52■■■■■ 5.52
CERS1-201ENST00000429504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.04■■■■■ 5.44
CERS1-201ENST00000429504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.67■■■■■ 5.38
CERS1-201ENST00000429504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
CERS1-201ENST00000429504 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.93■■■■■ 5.26
CERS1-201ENST00000429504 ABCC9O60706 1549 aa47.63■■■■■ 5.22
CERS1-201ENST00000429504 SCRIBQ14160 1630 aa47.32■■■■■ 5.17
CERS1-201ENST00000429504 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
CERS1-201ENST00000429504 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.9■■■■■ 5.1
CERS1-201ENST00000429504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
CERS1-201ENST00000429504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.57■■■■■ 5.05
CERS1-201ENST00000429504 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
CERS1-201ENST00000429504 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.98■■■■■ 4.95
CERS1-201ENST00000429504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.87■■■■■ 4.93
CERS1-201ENST00000429504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
CERS1-201ENST00000429504 WIZO95785 1651 aa45.72■■■■■ 4.91
CERS1-201ENST00000429504 SMARCA4P51532 1647 aa45.4■■■■■ 4.86
CERS1-201ENST00000429504 TRIM41Q8WV44 630 aa45.24■■■■■ 4.83
CERS1-201ENST00000429504 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.23■■■■■ 4.83
CERS1-201ENST00000429504 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.21■■■■■ 4.83
CERS1-201ENST00000429504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
CERS1-201ENST00000429504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
CERS1-201ENST00000429504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.94■■■■■ 4.78
CERS1-201ENST00000429504 SMARCA2P51531 1590 aa44.86■■■■■ 4.77
CERS1-201ENST00000429504 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.79■■■■■ 4.76
CERS1-201ENST00000429504 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.75■■■■■ 4.75
CERS1-201ENST00000429504 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.58■■■■■ 4.73
CERS1-201ENST00000429504 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
CERS1-201ENST00000429504 HRCP23327 699 aa44.38■■■■■ 4.69
CERS1-201ENST00000429504 ABCC8Q09428 1581 aa44.35■■■■■ 4.69
CERS1-201ENST00000429504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.28■■■■■ 4.68
CERS1-201ENST00000429504 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CERS1-201ENST00000429504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
CERS1-201ENST00000429504 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.9■■■■■ 4.62
CERS1-201ENST00000429504 EEA1Q15075 1411 aa43.86■■■■■ 4.61
CERS1-201ENST00000429504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.82■■■■■ 4.61
CERS1-201ENST00000429504 SOGA1O94964 1423 aa43.76■■■■■ 4.6
CERS1-201ENST00000429504 HMGXB3Q12766 1538 aa43.71■■■■■ 4.59
CERS1-201ENST00000429504 SYNJ1O43426 1573 aa43.65■■■■■ 4.58
CERS1-201ENST00000429504 NCAPD3P42695 1498 aa43.63■■■■■ 4.58
CERS1-201ENST00000429504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.54■■■■■ 4.56
CERS1-201ENST00000429504 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.52■■■■■ 4.56
CERS1-201ENST00000429504 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.47■■■■■ 4.55
CERS1-201ENST00000429504 CEP162Q5TB80 1403 aa43.39■■■■■ 4.54
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA3Q08378 1498 aa43.36■■■■■ 4.53
CERS1-201ENST00000429504 TOP2BQ02880 1626 aa43.33■■■■■ 4.53
CERS1-201ENST00000429504 KIF21BO75037 1637 aa43.28■■■■■ 4.52
CERS1-201ENST00000429504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.26■■■■■ 4.52
CERS1-201ENST00000429504 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.22■■■■■ 4.51
CERS1-201ENST00000429504 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
CERS1-201ENST00000429504 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
CERS1-201ENST00000429504 CFTRP13569 1480 aa43.08■■■■■ 4.49
CERS1-201ENST00000429504 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.48
CERS1-201ENST00000429504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.05■■■■■ 4.48
CERS1-201ENST00000429504 PRDM2Q13029 1718 aa43.02■■■■■ 4.48
CERS1-201ENST00000429504 CUX1P39880 1505 aa42.9■■■■■ 4.46
CERS1-201ENST00000429504 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.82■■■■■ 4.44
CERS1-201ENST00000429504 CLIP1P30622 1438 aa42.73■■■■■ 4.43
CERS1-201ENST00000429504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.73■■■■■ 4.43
CERS1-201ENST00000429504 PRXQ9BXM0 1461 aa42.65■■■■■ 4.42
CERS1-201ENST00000429504 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.62■■■■■ 4.41
CERS1-201ENST00000429504 KIF27Q86VH2 1401 aa42.57■■■■■ 4.41
CERS1-201ENST00000429504 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.55■■■■■ 4.4
CERS1-201ENST00000429504 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
CERS1-201ENST00000429504 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
CERS1-201ENST00000429504 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
CERS1-201ENST00000429504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.21■■■■■ 4.35
CERS1-201ENST00000429504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.2■■■■■ 4.35
CERS1-201ENST00000429504 CUX2O14529 1486 aa42.19■■■■■ 4.34
CERS1-201ENST00000429504 ARAP1Q96P48 1450 aa42.16■■■■■ 4.34
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.15■■■■■ 4.34
CERS1-201ENST00000429504 APLP2Q06481 763 aa42.12■■■■■ 4.33
CERS1-201ENST00000429504 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
CERS1-201ENST00000429504 IGF1RP08069 1367 aa42.07■■■■■ 4.32
CERS1-201ENST00000429504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.06■■■■■ 4.32
CERS1-201ENST00000429504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.95■■■■■ 4.31
CERS1-201ENST00000429504 NESP48681 1621 aa41.91■■■■■ 4.3
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.91■■■■■ 4.3
CERS1-201ENST00000429504 TOPBP1Q92547 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
CERS1-201ENST00000429504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.88■■■■■ 4.29
CERS1-201ENST00000429504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.84■■■■■ 4.29
CERS1-201ENST00000429504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.28
CERS1-201ENST00000429504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.71■■■■■ 4.27
CERS1-201ENST00000429504 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
CERS1-201ENST00000429504 CUL7Q14999 1698 aa41.65■■■■■ 4.26
CERS1-201ENST00000429504 WDR97A6NE52 1622 aa41.64■■■■■ 4.26
CERS1-201ENST00000429504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CERS1-201ENST00000429504 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CERS1-201ENST00000429504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.56■■■■■ 4.24
CERS1-201ENST00000429504 MAP3K1Q13233 1512 aa41.54■■■■■ 4.24
CERS1-201ENST00000429504 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
CERS1-201ENST00000429504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.44■■■■■ 4.23
CERS1-201ENST00000429504 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.44■■■■■ 4.22
CERS1-201ENST00000429504 TIAM1Q13009 1591 aa41.44■■■■■ 4.22
CERS1-201ENST00000429504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.43■■■■■ 4.22
CERS1-201ENST00000429504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.39■■■■■ 4.22
CERS1-201ENST00000429504 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.38■■■■■ 4.21
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