RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285949.5

CYP26C1-201, Transcript of cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYP26C1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1-201ENST00000285949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.61■■■■■ 8.09
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CYP26C1-201ENST00000285949 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.95■■■■■ 6.23
CYP26C1-201ENST00000285949 NACADO15069 1562 aa53.82■■■■■ 6.21
CYP26C1-201ENST00000285949 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.51■■■■■ 6.16
CYP26C1-201ENST00000285949 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.94■■■■■ 6.06
CYP26C1-201ENST00000285949 SCRIBQ14160 1630 aa52.77■■■■■ 6.04
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CYP26C1-201ENST00000285949 SMARCA4P51532 1647 aa50.57■■■■■ 5.69
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CYP26C1-201ENST00000285949 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.01■■■■■ 5.6
CYP26C1-201ENST00000285949 SMARCA2P51531 1590 aa49.94■■■■■ 5.58
CYP26C1-201ENST00000285949 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.93■■■■■ 5.58
CYP26C1-201ENST00000285949 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.82■■■■■ 5.57
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CYP26C1-201ENST00000285949 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.09■■■■■ 5.29
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CYP26C1-201ENST00000285949 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.77■■■■■ 5.24
CYP26C1-201ENST00000285949 TRIM41Q8WV44 630 aa47.72■■■■■ 5.23
CYP26C1-201ENST00000285949 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.69■■■■■ 5.22
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CYP26C1-201ENST00000285949 SYNJ1O43426 1573 aa47.45■■■■■ 5.19
CYP26C1-201ENST00000285949 CUX1P39880 1505 aa47.38■■■■■ 5.18
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CYP26C1-201ENST00000285949 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.16■■■■■ 5.14
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CYP26C1-201ENST00000285949 WDR97A6NE52 1622 aa46.46■■■■■ 5.03
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CYP26C1-201ENST00000285949 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.28■■■■■ 4.84
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