RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541300.5

ARMC10-211, Transcript of armadillo repeat containing 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARMC10, Length 2,266 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC10-211ENST00000541300 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.68■■■■■ 6.66
ARMC10-211ENST00000541300 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.37■■■■■ 5.33
ARMC10-211ENST00000541300 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.02■■■■■ 5.28
ARMC10-211ENST00000541300 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
ARMC10-211ENST00000541300 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
ARMC10-211ENST00000541300 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.7■■■■■ 5.07
ARMC10-211ENST00000541300 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.62■■■■■ 5.05
ARMC10-211ENST00000541300 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.81■■■■■ 4.92
ARMC10-211ENST00000541300 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.64■■■■■ 4.9
ARMC10-211ENST00000541300 ABCC9O60706 1549 aa45.28■■■■■ 4.84
ARMC10-211ENST00000541300 SCRIBQ14160 1630 aa45.15■■■■■ 4.82
ARMC10-211ENST00000541300 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
ARMC10-211ENST00000541300 NACADO15069 1562 aa44.67■■■■■ 4.74
ARMC10-211ENST00000541300 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.35■■■■■ 4.69
ARMC10-211ENST00000541300 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.34■■■■■ 4.69
ARMC10-211ENST00000541300 HRCP23327 699 aa44.29■■■■■ 4.68
ARMC10-211ENST00000541300 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.24■■■■■ 4.67
ARMC10-211ENST00000541300 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.11■■■■■ 4.65
ARMC10-211ENST00000541300 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
ARMC10-211ENST00000541300 TRIM41Q8WV44 630 aa43.92■■■■■ 4.62
ARMC10-211ENST00000541300 WIZO95785 1651 aa43.78■■■■■ 4.6
ARMC10-211ENST00000541300 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
ARMC10-211ENST00000541300 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
ARMC10-211ENST00000541300 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
ARMC10-211ENST00000541300 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.28■■■■■ 4.52
ARMC10-211ENST00000541300 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
ARMC10-211ENST00000541300 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
ARMC10-211ENST00000541300 SMARCA4P51532 1647 aa43.21■■■■■ 4.51
ARMC10-211ENST00000541300 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
ARMC10-211ENST00000541300 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.97■■■■■ 4.47
ARMC10-211ENST00000541300 SMARCA2P51531 1590 aa42.91■■■■■ 4.46
ARMC10-211ENST00000541300 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.91■■■■■ 4.46
ARMC10-211ENST00000541300 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
ARMC10-211ENST00000541300 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.71■■■■■ 4.43
ARMC10-211ENST00000541300 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
ARMC10-211ENST00000541300 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.54■■■■■ 4.4
ARMC10-211ENST00000541300 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.44■■■■■ 4.38
ARMC10-211ENST00000541300 SOGA1O94964 1423 aa42.29■■■■■ 4.36
ARMC10-211ENST00000541300 EEA1Q15075 1411 aa42.23■■■■■ 4.35
ARMC10-211ENST00000541300 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.34
ARMC10-211ENST00000541300 CEP162Q5TB80 1403 aa42.13■■■■■ 4.33
ARMC10-211ENST00000541300 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.09■■■■■ 4.33
ARMC10-211ENST00000541300 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.07■■■■■ 4.32
ARMC10-211ENST00000541300 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.06■■■■■ 4.32
ARMC10-211ENST00000541300 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.05■■■■■ 4.32
ARMC10-211ENST00000541300 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
ARMC10-211ENST00000541300 GOLGA3Q08378 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
ARMC10-211ENST00000541300 SYNJ1O43426 1573 aa41.89■■■■■ 4.3
ARMC10-211ENST00000541300 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
ARMC10-211ENST00000541300 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
ARMC10-211ENST00000541300 KIF21BO75037 1637 aa41.67■■■■■ 4.26
ARMC10-211ENST00000541300 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.67■■■■■ 4.26
ARMC10-211ENST00000541300 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
ARMC10-211ENST00000541300 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
ARMC10-211ENST00000541300 TOP2BQ02880 1626 aa41.44■■■■■ 4.22
ARMC10-211ENST00000541300 CLIP1P30622 1438 aa41.36■■■■■ 4.21
ARMC10-211ENST00000541300 HMGXB3Q12766 1538 aa41.35■■■■■ 4.21
ARMC10-211ENST00000541300 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.33■■■■■ 4.21
ARMC10-211ENST00000541300 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.3■■■■■ 4.2
ARMC10-211ENST00000541300 NCAPD3P42695 1498 aa41.28■■■■■ 4.2
ARMC10-211ENST00000541300 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.2■■■■■ 4.19
ARMC10-211ENST00000541300 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.02■■■■■ 4.16
ARMC10-211ENST00000541300 CUX1P39880 1505 aa41■■■■■ 4.15
ARMC10-211ENST00000541300 PRXQ9BXM0 1461 aa40.97■■■■■ 4.15
ARMC10-211ENST00000541300 CFTRP13569 1480 aa40.94■■■■■ 4.14
ARMC10-211ENST00000541300 APLP2Q06481 763 aa40.92■■■■■ 4.14
ARMC10-211ENST00000541300 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
ARMC10-211ENST00000541300 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
ARMC10-211ENST00000541300 KIF27Q86VH2 1401 aa40.79■■■■■ 4.12
ARMC10-211ENST00000541300 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
ARMC10-211ENST00000541300 ARAP1Q96P48 1450 aa40.73■■■■■ 4.11
ARMC10-211ENST00000541300 PRDM2Q13029 1718 aa40.73■■■■■ 4.11
ARMC10-211ENST00000541300 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
ARMC10-211ENST00000541300 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
ARMC10-211ENST00000541300 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.45■■■■■ 4.07
ARMC10-211ENST00000541300 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
ARMC10-211ENST00000541300 CUX2O14529 1486 aa40.39■■■■■ 4.06
ARMC10-211ENST00000541300 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.38■■■■■ 4.06
ARMC10-211ENST00000541300 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
ARMC10-211ENST00000541300 IGF1RP08069 1367 aa40.31■■■■■ 4.04
ARMC10-211ENST00000541300 NEUROD1Q13562 356 aa40.3■■■■■ 4.04
ARMC10-211ENST00000541300 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.27■■■■■ 4.04
ARMC10-211ENST00000541300 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
ARMC10-211ENST00000541300 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.25■■■■■ 4.03
ARMC10-211ENST00000541300 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
ARMC10-211ENST00000541300 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.16■■■■■ 4.02
ARMC10-211ENST00000541300 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.14■■■■■ 4.02
ARMC10-211ENST00000541300 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
ARMC10-211ENST00000541300 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.07■■■■■ 4.01
ARMC10-211ENST00000541300 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.05■■■■■ 4
ARMC10-211ENST00000541300 MAP3K1Q13233 1512 aa39.99■■■■□ 3.99
ARMC10-211ENST00000541300 TIAM1Q13009 1591 aa39.98■■■■□ 3.99
ARMC10-211ENST00000541300 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.95■■■■□ 3.99
ARMC10-211ENST00000541300 MIER1Q8N108 512 aa39.88■■■■□ 3.97
ARMC10-211ENST00000541300 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.88■■■■□ 3.97
ARMC10-211ENST00000541300 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.84■■■■□ 3.97
ARMC10-211ENST00000541300 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
ARMC10-211ENST00000541300 TOPBP1Q92547 1522 aa39.82■■■■□ 3.97
ARMC10-211ENST00000541300 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.81■■■■□ 3.96
ARMC10-211ENST00000541300 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.8■■■■□ 3.96
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