RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371116.3

FOXD3-201, Transcript of forkhead box D3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXD3, Length 2,086 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-201ENST00000371116 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.39■■■■■ 7.1
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FOXD3-201ENST00000371116 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.31■■■■■ 5.48
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FOXD3-201ENST00000371116 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.92■■■■■ 5.42
FOXD3-201ENST00000371116 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.07■■■■■ 5.29
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FOXD3-201ENST00000371116 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.95■■■■■ 4.95
FOXD3-201ENST00000371116 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.92■■■■■ 4.94
FOXD3-201ENST00000371116 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
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FOXD3-201ENST00000371116 SMARCA4P51532 1647 aa45.42■■■■■ 4.86
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FOXD3-201ENST00000371116 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.79■■■■■ 4.76
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FOXD3-201ENST00000371116 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.76■■■■■ 4.76
FOXD3-201ENST00000371116 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
FOXD3-201ENST00000371116 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.71■■■■■ 4.75
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FOXD3-201ENST00000371116 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
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FOXD3-201ENST00000371116 ABCC8Q09428 1581 aa44.14■■■■■ 4.66
FOXD3-201ENST00000371116 NCAPD3P42695 1498 aa43.9■■■■■ 4.62
FOXD3-201ENST00000371116 HMGXB3Q12766 1538 aa43.87■■■■■ 4.61
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FOXD3-201ENST00000371116 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.63■■■■■ 4.57
FOXD3-201ENST00000371116 EEA1Q15075 1411 aa43.61■■■■■ 4.57
FOXD3-201ENST00000371116 SOGA1O94964 1423 aa43.56■■■■■ 4.56
FOXD3-201ENST00000371116 SYNJ1O43426 1573 aa43.49■■■■■ 4.55
FOXD3-201ENST00000371116 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
FOXD3-201ENST00000371116 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.36■■■■■ 4.53
FOXD3-201ENST00000371116 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.33■■■■■ 4.53
FOXD3-201ENST00000371116 HRCP23327 699 aa43.26■■■■■ 4.52
FOXD3-201ENST00000371116 CFTRP13569 1480 aa43.22■■■■■ 4.51
FOXD3-201ENST00000371116 TOP2BQ02880 1626 aa43.21■■■■■ 4.51
FOXD3-201ENST00000371116 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.15■■■■■ 4.5
FOXD3-201ENST00000371116 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.13■■■■■ 4.49
FOXD3-201ENST00000371116 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.11■■■■■ 4.49
FOXD3-201ENST00000371116 GOLGA3Q08378 1498 aa43.08■■■■■ 4.49
FOXD3-201ENST00000371116 CEP162Q5TB80 1403 aa43.01■■■■■ 4.48
FOXD3-201ENST00000371116 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.97■■■■■ 4.47
FOXD3-201ENST00000371116 KIF21BO75037 1637 aa42.96■■■■■ 4.47
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FOXD3-201ENST00000371116 PRDM2Q13029 1718 aa42.89■■■■■ 4.46
FOXD3-201ENST00000371116 CUX1P39880 1505 aa42.89■■■■■ 4.46
FOXD3-201ENST00000371116 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.89■■■■■ 4.46
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FOXD3-201ENST00000371116 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.5■■■■■ 4.39
FOXD3-201ENST00000371116 CLIP1P30622 1438 aa42.46■■■■■ 4.39
FOXD3-201ENST00000371116 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.41■■■■■ 4.38
FOXD3-201ENST00000371116 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
FOXD3-201ENST00000371116 CUX2O14529 1486 aa42.22■■■■■ 4.35
FOXD3-201ENST00000371116 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
FOXD3-201ENST00000371116 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.21■■■■■ 4.35
FOXD3-201ENST00000371116 NESP48681 1621 aa42.2■■■■■ 4.35
FOXD3-201ENST00000371116 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.2■■■■■ 4.35
FOXD3-201ENST00000371116 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.16■■■■■ 4.34
FOXD3-201ENST00000371116 IGF1RP08069 1367 aa42.09■■■■■ 4.33
FOXD3-201ENST00000371116 TOPBP1Q92547 1522 aa42.04■■■■■ 4.32
FOXD3-201ENST00000371116 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
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FOXD3-201ENST00000371116 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.91■■■■■ 4.3
FOXD3-201ENST00000371116 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.91■■■■■ 4.3
FOXD3-201ENST00000371116 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.9■■■■■ 4.3
FOXD3-201ENST00000371116 APLP2Q06481 763 aa41.89■■■■■ 4.3
FOXD3-201ENST00000371116 ARAP1Q96P48 1450 aa41.89■■■■■ 4.3
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FOXD3-201ENST00000371116 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.84■■■■■ 4.29
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FOXD3-201ENST00000371116 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
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FOXD3-201ENST00000371116 CUL7Q14999 1698 aa41.57■■■■■ 4.24
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FOXD3-201ENST00000371116 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
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FOXD3-201ENST00000371116 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
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FOXD3-201ENST00000371116 MAP3K1Q13233 1512 aa41.25■■■■■ 4.19
FOXD3-201ENST00000371116 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.24■■■■■ 4.19
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